RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571442.5

SMG6-209, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, human

TSL 4

Gene SMG6, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMG6-209	ENST00000571442	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	SNAPIN	O95295	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	S100P	P25815	95 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	FCER1G	P30273	86 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	SVBP	Q8N300	66 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	PRSS1	P07477	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	HAMP	P81172	84 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442		Q8N8P6	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	RMI2	Q96E14	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	EREG	O14944	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	SLPI	P03973	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	FOXI1	Q12951	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	CCL25	O15444	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	XCL1	P47992	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	XG	P55808	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	SCO1	O75880	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	GCSH	P23434	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMG6-209	ENST00000571442		A0A096LNJ9	63 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	MT-ND6	P03923	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	RAB5A	P20339	215 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	COX19	Q49B96	90 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	PANO1	I0J062	215 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	COX6A2	Q02221	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	SS18	Q15532	418 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	COLCA2	A8K830	154 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442		Q6ZSA8	131 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442		Q8N1X5	172 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	AMELX	Q99217	191 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442		K7EMI3	77 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMG6-209	ENST00000571442	TRGC2	P03986	189 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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