RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 UBE2D2P62837 147 aa16.55■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 RPL24P83731 157 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 GAGE13Q4V321 117 aa16.55■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa16.55■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa16.55■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 A4D1N5 150 aa16.54■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 MUSTN1Q8IVN3 82 aa16.54■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 SFTA2Q6UW10 78 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 GAGE12JA6NER3 117 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 LINC00694P0DN24 101 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 TIRAPP58753 221 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 GAGE4Q13068 117 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 GAGE5Q13069 117 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 ARL17AQ8IVW1 177 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 LITAFQ99732 161 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 PRO1854Q9UHT4 67 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 NDUFA12Q9UI09 145 aa16.53■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 JMJD1CQ15652 2540 aa16.52■□□□□ 0.24
EHD4-202ENST00000569223 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa16.52■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 A8MZ25 164 aa16.52■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 GAGE7O76087 117 aa16.52■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 GAGE12FP0CL80 117 aa16.52■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 GAGE12GP0CL81 117 aa16.52■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 GAGE12IP0CL82 117 aa16.52■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 MTURNQ8N3F0 131 aa16.52■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 SBSPONQ8IVN8 264 aa16.51■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa16.51■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 PCP4P48539 62 aa16.5■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 OVOL2Q9BRP0 275 aa16.5■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 TRGV2A0A075B6R0 118 aa16.5■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 LYRM7Q5U5X0 104 aa16.5■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 LY6G6DO95868 133 aa16.49■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 PSMB2P49721 201 aa16.49■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.48■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 A0A0B4J2C4 111 aa16.48■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 ZFAND6Q6FIF0 208 aa16.48■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 COX6A2Q02221 97 aa16.48■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 FASNP49327 2511 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 PF4P02776 101 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 SH2D6Q7Z4S9 175 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 LINC00482Q8N8I6 264 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 SPANXDQ9BXN6 97 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 SPANXCQ9NY87 97 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 HIVEP2P31629 2446 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 IGHV3-33P01772 117 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 ETDBQ3ZM63 59 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 LINC00242Q5T6M2 205 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa16.46■□□□□ 0.23
EHD4-202ENST00000569223 NOTCH3Q9UM47 2321 aa16.45■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 CIDEAO60543 219 aa16.45■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 HERVK_113P63121 156 aa16.45■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 TMEM101Q96IK0 257 aa16.45■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa16.45■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 GTSF1LQ9H1H1 148 aa16.45■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa16.44■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 TCL1BO95988 128 aa16.43■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 SMAGPQ0VAQ4 97 aa16.43■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 MIAQ16674 131 aa16.43■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa16.43■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa16.42■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 TMEM243Q9BU79 118 aa16.42■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 ERG28Q9UKR5 140 aa16.42■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa16.41■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa16.41■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 NDUFA1O15239 70 aa16.41■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 PRSS2P07478 247 aa16.41■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa16.41■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa16.4■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 UBE2L6O14933 153 aa16.4■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 TIMM17BO60830 172 aa16.4■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 SCGB1C2P0DMR2 95 aa16.4■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 FHL2Q14192 279 aa16.4■□□□□ 0.22
EHD4-202ENST00000569223 H7C2G1 150 aa16.38■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 SMIM1B2RUZ4 78 aa16.37■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 H7C423 109 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 NPC2P61916 151 aa16.36■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 J3QR89 54 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 CRLF1O75462 422 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 Q1RN00 199 aa16.35■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 INAFM1C9JVW0 142 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 F5H768 121 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 Q9H8V8 135 aa16.34■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 IFITM1P13164 125 aa16.33■□□□□ 0.21
EHD4-202ENST00000569223 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa16.33■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 RNF183Q96D59 192 aa16.33■□□□□ 0.2
EHD4-202ENST00000569223 INSL3P51460 131 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.5 ms