RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 VCX2Q9H322 139 aa13.17□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa13.16□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 FGF6P10767 208 aa13.16□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 C11orf45Q8TAV5 145 aa13.16□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.16□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 A0A096LPF7 62 aa13.15□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 C11orf86A6NJI1 115 aa13.15□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.15□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.15□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa13.15□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa13.15□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa13.14□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.14□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 SPANXA1Q9NS26 97 aa13.14□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.13□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 TMEM170BQ5T4T1 132 aa13.13□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 B9D2Q9BPU9 175 aa13.13□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.12□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 C2orf91Q6ZV80 131 aa13.12□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.11□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa13.11□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa13.11□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 Q6ZUT4 128 aa13.11□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 FAM104AQ969W3 186 aa13.11□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 TMEM243Q9BU79 118 aa13.11□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 CHAC1Q9BUX1 264 aa13.11□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.11□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 COL7A1Q02388 2944 aa13.1□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 A0A0J9YXV3 536 aa13.09□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 MPV17L2Q567V2 206 aa13.09□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 UBE2L6O14933 153 aa13.09□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 DLEU1O43261 78 aa13.09□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 HERVK_113P61574 105 aa13.09□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 AMELXQ99217 191 aa13.09□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.09□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 DNAH9Q9NYC9 4486 aa13.09□□□□□ -0.31
INO80E-211ENST00000567987 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa13.08□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 NPSP0C0P6 89 aa13.07□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.07□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 E9PLD3 99 aa13.07□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 NFE4Q86UQ8 179 aa13.07□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.07□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.07□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 A0A1B0GV90 55 aa13.06□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa13.06□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 GAGE6Q13070 117 aa13.05□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 H3BNG1 76 aa13.05□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 H7C423 109 aa13.05□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa13.04□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 SIVA1O15304 175 aa13.04□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa13.04□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.04□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa13.03□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 OR5A1Q8NGJ0 315 aa13.03□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 SMAGPQ0VAQ4 97 aa13.03□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.03□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa13.02□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 TMEM101Q96IK0 257 aa13.02□□□□□ -0.32
INO80E-211ENST00000567987 TRAV10A0A0B4J240 114 aa13.01□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa13.01□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 ZNF815PA8K554 130 aa13.01□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 TMEM223A0PJW6 202 aa13□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 HSD52Q0P140 79 aa13□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 STAB2Q8WWQ8 2551 aa13□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 TMEM262E9PQX1 116 aa13□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 UBE2D1P51668 147 aa13□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 LYPD5Q6UWN5 251 aa13□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa12.99□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 LINC00469Q8N7U9 141 aa12.99□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 HIGD1BQ9P298 99 aa12.99□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa12.98□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.98□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 LELP1Q5T871 98 aa12.98□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 SCGB1D4Q6XE38 83 aa12.98□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 J3QQQ9 107 aa12.96□□□□□ -0.33
INO80E-211ENST00000567987 LEPROTO15243 131 aa12.96□□□□□ -0.34
INO80E-211ENST00000567987 RBX1P62877 108 aa12.96□□□□□ -0.34
INO80E-211ENST00000567987 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.95□□□□□ -0.34
INO80E-211ENST00000567987 SPINK8P0C7L1 97 aa12.95□□□□□ -0.34
INO80E-211ENST00000567987 GCSHP23434 173 aa12.95□□□□□ -0.34
INO80E-211ENST00000567987 PLEKHB2Q96CS7 222 aa12.95□□□□□ -0.34
INO80E-211ENST00000567987 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa12.94□□□□□ -0.34
INO80E-211ENST00000567987 A0A1B0GUV1 79 aa12.94□□□□□ -0.34
INO80E-211ENST00000567987 ORAOV1Q8WV07 137 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms