RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565404.1

TCF25-215, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-215	ENST00000565404	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	DAD1	P61803	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	RASL10A	Q92737	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404		D6R8Y8	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	RS1	O15537	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	MGP	P08493	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404		Q6ZTI0	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404		Q8N377	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	NCR2	O95944	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	PPP1R17	O96001	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	S100A6	P06703	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	CRYGD	P07320	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	CKS2	P33552	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	LINC00315	P59091	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404		Q0VG73	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	ZNF56	Q15929	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	IGLL5	B9A064	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404		H7C1H1	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	NPY	P01303	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	MT3	P25713	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	FAT1	Q14517	4588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404		F5H768	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	NDUFA6	P56556	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404		M0QY20	66 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	SERF1A	O75920	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	ATP5G1	P05496	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	ESD	P10768	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	VCX2	Q9H322	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404		A0A0J9YY99	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	PMCH	P20382	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF25-215	ENST00000565404	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCF25-215	ENST00000565404	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TCF25-215	ENST00000565404	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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