RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 MRAP2Q96G30 205 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 MYCBP2O75592 4640 aa4.81□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 I3L3M4 83 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBE2L6O14933 153 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 TSHBP01222 138 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 HLA-DQA1P01909 254 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 APCSP02743 223 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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UBE2CP4-201ENST00000561405 LINC01620Q4KN68 170 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 AMN1Q8IY45 258 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.8□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A1B0GW15 77 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 FGF6P10767 208 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 PMCHP20382 165 aa4.79□□□□□ -1.64
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UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.79□□□□□ -1.64
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UBE2CP4-201ENST00000561405 NRACQ8N912 160 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 ST20Q9HBF5 79 aa4.79□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 A0A1B0GXF2 115 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPP1R17O96001 155 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.78□□□□□ -1.64
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UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.78□□□□□ -1.64
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.77□□□□□ -1.65
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UBE2CP4-201ENST00000561405 SMKR1H3BMG3 65 aa4.77□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 VCYO14598 125 aa4.77□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLPIP03973 132 aa4.77□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
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UBE2CP4-201ENST00000561405 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.77□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.77□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 C15orf56Q8N910 161 aa4.77□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.77□□□□□ -1.65
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UBE2CP4-201ENST00000561405 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.77□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.77□□□□□ -1.65
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UBE2CP4-201ENST00000561405 LCE1DQ5T752 114 aa4.76□□□□□ -1.65
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UBE2CP4-201ENST00000561405 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 C20orf78Q9BR46 151 aa4.76□□□□□ -1.65
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UBE2CP4-201ENST00000561405 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 hDV102S1A0JD36 115 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 PHOX2AO14813 284 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 S100A8P05109 93 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 CAMPP49913 170 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 CLLU1Q5K131 121 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 CFAP161Q6P656 301 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM101Q96IK0 257 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 BTF3L4Q96K17 158 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIR2DL4Q99706 377 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 F8W036 122 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 PANO1I0J062 215 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 TCAPO15273 167 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 TNFRSF6BO95407 300 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPBPP02775 128 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 CKS2P33552 79 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 RAB14P61106 215 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRSS47A8MTI9 375 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 D6R8Y8 96 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 CCL25O15444 150 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 FCER1GP30273 86 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 IFITM2Q01629 132 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM104AQ969W3 186 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.72□□□□□ -1.65
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