RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 GATD1Q8NB37 220 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 OR10G8Q8NGN5 311 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 LYPD6BQ8NI32 183 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 PTH2Q96A98 100 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 GFRA4Q9GZZ7 299 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 BIN3Q9NQY0 253 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 NAT8Q9UHE5 227 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 V9GYV3 84 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.83□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 A0A087WWC5 75 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 A8MWL6 223 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 F2Z2F3 143 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 H7C1H1 209 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 APCSP02743 223 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 RAB14P61106 215 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 RBX1P62877 108 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 COTL1Q14019 142 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 PEA15Q15121 130 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM241Q24JQ0 296 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 COMMD7Q86VX2 200 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 Q8N814 137 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 NUP35Q8NFH5 326 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 SMIM12Q96EX1 92 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM243Q9BU79 118 aa2.82□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1B0GUT8 65 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 SDHAF1A6NFY7 115 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 CIDEAO60543 219 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 ADCYAP1P18509 176 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 PMCHP20382 165 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 IFITM2Q01629 132 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 HIGD2BQ4VC39 106 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 LCE1EQ5T753 118 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 ENHOQ6UWT2 76 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 FAM231DQ6ZW35 169 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 TSKUQ8WUA8 353 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 NIT2Q9NQR4 276 aa2.81□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 D6R8Y8 96 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 NPYP01303 97 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 FCER1GP30273 86 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 REG3AQ06141 175 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 RIGQ13278 110 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 LAGE3Q14657 143 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZUT4 128 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 RNF185Q96GF1 192 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 ST20Q9HBF5 79 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 OSTCQ9NRP0 149 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 HERC2O95714 4834 aa2.8□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 DNAH5Q8TE73 4624 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 F8W036 122 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 TCAPO15273 167 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 FGF6P10767 208 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 RAB4AP20338 218 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 XCL1P47992 114 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 RPL39P62891 51 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 HBBP68871 147 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 IQCJQ1A5X6 159 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 FAM74A3Q4VXF1 159 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 CLLU1Q5K131 121 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 Q5VSD8 79 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 RMI2Q96E14 147 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 MRAP2Q96G30 205 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM70Q9BUB7 260 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 CHCHD7Q9BUK0 85 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 CNFNQ9BYD5 112 aa2.79□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 C7orf77A4D0Y5 90 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 I3L3M4 83 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 CCL25O15444 150 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 CHTF8P0CG12 524 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 CKS2P33552 79 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 ELOBQ15370 118 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 MIAQ16674 131 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 OR5A1Q8NGJ0 315 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 IMMP2LQ96T52 175 aa2.78□□□□□ -1.96
TMOD3-204ENST00000558666 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms