RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 PMCHP20382 165 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 TWIST1Q15672 202 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 MRAP2Q96G30 205 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 BIN3Q9NQY0 253 aa7.15□□□□□ -1.26
CS-228ENST00000551473 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 BCL2L11O43521 198 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 ESDP10768 282 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 UMAD1C9J7I0 102 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 CTRLP40313 264 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 Q5BKY6 102 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 CENPWQ5EE01 88 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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CS-228ENST00000551473 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 IMMP2LQ96T52 175 aa7.13□□□□□ -1.27
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CS-228ENST00000551473 A0A1B0GV50 99 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 F8WDY8 70 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 C11orf52Q96A22 123 aa7.12□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 G3V3Q6 166 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 GNG4P50150 75 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 UBE2BP63146 152 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 SPAG11BQ08648 103 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 MANBALQ9NQG1 85 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 TSPAN13O95857 204 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 CCL20P78556 96 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.1□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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CS-228ENST00000551473 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 ST20Q9HBF5 79 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-228ENST00000551473 NDUFA1O15239 70 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 TSHBP01222 138 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.08□□□□□ -1.28
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CS-228ENST00000551473 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.08□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 M0QXV9 152 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 ARPC5O15511 151 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 C5orf38Q86SI9 138 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 FAM168BA1KXE4 195 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 ZNF861PO60384 105 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 NUDT11Q96G61 164 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 CDIP1Q9H305 208 aa7.06□□□□□ -1.28
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CS-228ENST00000551473 PDE6DO43924 150 aa7.05□□□□□ -1.28
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CS-228ENST00000551473 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 NUPR1O60356 82 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 FCER1GP30273 86 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 GAGE2EQ4V326 116 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.04□□□□□ -1.28
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CS-228ENST00000551473 TPRXLQ17RH7 258 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 TMEM18Q96B42 140 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 BORCS7Q96B45 105 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 MED9Q9NWA0 146 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-228ENST00000551473 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.03□□□□□ -1.28
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CS-228ENST00000551473 ZNF345Q14585 488 aa7.02□□□□□ -1.29
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CS-228ENST00000551473 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 VCYO14598 125 aa7.01□□□□□ -1.29
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CS-228ENST00000551473 TIMM21Q9BVV7 248 aa7□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 MUC17Q685J3 4493 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 A8MWL6 223 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 C10orf25Q5T742 122 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 Q6ZUT4 128 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-228ENST00000551473 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.99□□□□□ -1.29
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