RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 SSPOA2VEC9 5147 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 PET100P0DJ07 73 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 FHITP49789 147 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 SPAG11BQ08648 103 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 TPPP3Q9BW30 176 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-208ENST00000547298 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 GAGE2EQ4V326 116 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 C5orf38Q86SI9 138 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 BAGE2Q86Y30 109 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 TMEM101Q96IK0 257 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 BTF3L4Q96K17 158 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 IMMP2LQ96T52 175 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 DEFA1P59665 94 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 USH2AO75445 5202 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 TRGC1P0CF51 173 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 CTAG1AP78358 180 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 CST9LP1Q5W188 147 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 STOML3Q8TAV4 291 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 NUPR1O60356 82 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 F8WDY8 70 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 I3L3M4 83 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 PAGE4O60829 102 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 CCDC32Q9BV29 185 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-208ENST00000547298 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 F2Z2F3 143 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 NDUFA1O15239 70 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 CTRLP40313 264 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 ALG5Q9Y673 324 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 PMCHP20382 165 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 MRAP2Q96G30 205 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 CNFNQ9BYD5 112 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 C22orf24Q9Y442 160 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 BCE1O60756 84 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 TMUB2Q71RG4 321 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 KIAA0087Q14695 138 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 TWIST1Q15672 202 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 SSNA1O43805 119 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 IFNA1P01562 189 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 Q6ZUT4 128 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 FAM104AQ969W3 186 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-208ENST00000547298 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 Q5BKY6 102 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 ENKURQ8TC29 256 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 XP32Q5T750 250 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 C2orf82Q6UX34 121 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 FAM210AQ96ND0 272 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 XKRY2A2RUG3 117 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CS-208ENST00000547298 CENPWQ5EE01 88 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms