RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-208	ENST00000546997	ATXN8	Q156A1	80 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-208	ENST00000546997	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-208	ENST00000546997	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-208	ENST00000546997	ODF3	Q96PU9	254 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-208	ENST00000546997		J3QQQ9	107 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	IFITM1	P13164	125 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997		C9JAW5	83 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TTC32	Q5I0X7	151 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	SFTA2	Q6UW10	78 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	KNCN	A6PVL3	124 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	LEPROT	O15243	131 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	KIR2DL4	Q99706	377 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	SPRY2	O43597	315 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997		B5MCH6	92 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	MGP	P08493	103 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997		Q8N1Y9	231 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997		A4D1N5	150 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	LINC00315	P59091	139 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	LINC01620	Q4KN68	170 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	DNHD1	Q96M86	4753 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	RHOH	Q15669	191 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM223	A0PJW6	202 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997		H3BMM0	161 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-208	ENST00000546997	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	MUC4	Q99102	2169 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997		H3BT86	120 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997		M0R2P5	195 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	WIPF1	O43516	503 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997		A8MTW9	85 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.91	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	COX6C	P09669	75 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	EMP1	P54849	157 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	STH	Q8IWL8	128 aa		11.9	□□□□□ -0.5
BRF1-208	ENST00000546997	CCDC179	H3BU77	68 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM126A	Q9H061	195 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997		Q1RN00	199 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	JPT2	Q9H910	190 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	SPANXC	Q9NY87	97 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	MAL	P21145	153 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	IMUP	Q9GZP8	106 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997		A0A0J9YXY3	114 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	C2orf82	Q6UX34	121 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	TRIAP1	O43715	76 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BRF1-208	ENST00000546997	ACYP1	P07311	99 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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