RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125		G3V318	75 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125		M0R143	59 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SPINK1	P00995	79 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	S100A8	P05109	93 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SEC11A	P67812	179 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	HAMP	P81172	84 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125		Q0VG73	95 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125		Q6JHZ5	121 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TSLP	Q969D9	159 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	VAMP8	Q9BV40	100 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	DPY30	Q9C005	99 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	LAMB1	P07942	1786 aa		0.22	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	CACNA1C	Q13936	2221 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		A0A1B0GWA3	101 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	GNGT2	O14610	69 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	MPC2	O95563	127 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	IGLC1	P0CG04	106 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	S100A10	P60903	97 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	UBE2D3	P61077	147 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	UBE2D2	P62837	147 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		Q5BKY6	102 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PRO1933	Q9H354	126 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00846	Q9NV44	126 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PZP	P20742	1482 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	MRC1	P22897	1456 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		0.21	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	hADV29S1	A0JD25	119 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ATOX1	O00244	68 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	BCE1	O60756	84 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PKIA	P61925	76 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PMCHL1	Q16048	86 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PIGY	Q3MUY2	71 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	SPRR4	Q96PI1	79 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	TRGV9	Q99603	122 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	GOLGA3	Q08378	1498 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		0.2	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	MYH7	P12883	1935 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		M0R3E3	92 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ASIP	P42127	132 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	SMIM11A	P58511	58 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	HMGN3	Q15651	99 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	SFTA2	Q6UW10	78 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		Q8IZM0	81 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	SERP2	Q8N6R1	65 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PRO0255	Q9UI72	69 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	UNC13B	O14795	1591 aa		0.19	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PLCE1	Q9P212	2302 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	FAM223B	A6NKX1	122 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		H3BQF6	201 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	GYPA	P02724	150 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	MT-ATP8	P03928	68 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	UQCRH	P07919	91 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PSMG4	Q5JS54	123 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		Q9H521	79 aa		0.18	□□□□□ -2.38

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