RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6ZQT7 251 aa4.06□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATOH7Q8N100 152 aa4.06□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AP1S3Q96PC3 154 aa4.06□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NACAE9PAV3 2078 aa4.06□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.05□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.05□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.05□□□□□ -1.76
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPATA45Q537H7 98 aa4.05□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TTC32Q5I0X7 151 aa4.05□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.05□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.05□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.05□□□□□ -1.76
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.05□□□□□ -1.76
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A8MWV9 139 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H3BRM9 83 aa4.04□□□□□ -1.76
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.04□□□□□ -1.76
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEFB135Q30KP9 77 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.04□□□□□ -1.76
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR10AG1Q8NH19 301 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNFNQ9BYD5 112 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM262E9PQX1 116 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R17O96001 155 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MGPP08493 103 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MIFP14174 115 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CKS2P33552 79 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NMUP48645 174 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.04□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q75L30 129 aa4.04□□□□□ -1.76
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0U1RQV1 116 aa4.03□□□□□ -1.76
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM231CP0DMU5 169 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PFN2P35080 140 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEC11AP67812 179 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAGE2BQ13066 116 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF56Q15929 161 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAGE2EQ4V326 116 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ORMDL3Q8N138 153 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.03□□□□□ -1.76
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.02□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.02□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.02□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYRM9A8MSI8 78 aa4.02□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.02□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.02□□□□□ -1.77
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMN1Q8IY45 258 aa4.02□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.02□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMKR1H3BMG3 65 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NXPH4O95158 308 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRM2P04554 102 aa4.01□□□□□ -1.77
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C12orf74Q32Q52 190 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6ZRU5 148 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRELID3AQ96N28 172 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 D6R8Y8 96 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 K7EIL1 84 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DAD1P61803 113 aa4.01□□□□□ -1.77
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.01□□□□□ -1.77
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