RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 PRR34Q9NV39 138 aa7.58□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00862A6NCI5 91 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 USP17L23D6RBM5 183 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 H7C423 109 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 CDK2AP2O75956 126 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 TNFRSF6BO95407 300 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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UBASH3B-208ENST00000533451 C14orf177Q52M58 125 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 SEC11CQ9BY50 192 aa7.57□□□□□ -1.2
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UBASH3B-208ENST00000533451 C20orf78Q9BR46 151 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.56□□□□□ -1.2
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UBASH3B-208ENST00000533451 S100PP25815 95 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.55□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.54□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.54□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC01620Q4KN68 170 aa7.54□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM18Q96B42 140 aa7.54□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.53□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.53□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 TCAPO15273 167 aa7.53□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 ESDP10768 282 aa7.53□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB5AP20339 215 aa7.53□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 HAMPP81172 84 aa7.53□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.53□□□□□ -1.2
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.52□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 hDV102S1A0JD36 115 aa7.52□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 PHOX2AO14813 284 aa7.52□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 XCL1P47992 114 aa7.52□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 NDUFA5Q16718 116 aa7.52□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 IMMP2LQ96T52 175 aa7.52□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.52□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 APOC3P02656 99 aa7.51□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 PRSS1P07477 247 aa7.51□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 SS18Q15532 418 aa7.51□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.51□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 CCL25O15444 150 aa7.5□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 RHEBQ15382 184 aa7.5□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.5□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.49□□□□□ -1.21
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UBASH3B-208ENST00000533451 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.49□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.49□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 CFAP161Q6P656 301 aa7.49□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.49□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.49□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.49□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.48□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.48□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 Q6ZUT4 128 aa7.48□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 SNAPINO95295 136 aa7.47□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 MALP21145 153 aa7.47□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.47□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 HERC2O95714 4834 aa7.47□□□□□ -1.21
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.46□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 XGP55808 180 aa7.46□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 Q8N1X5 172 aa7.46□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 SVBPQ8N300 66 aa7.46□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 Q8N8P6 123 aa7.46□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.46□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.46□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 IFITM10A6NMD0 228 aa7.45□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.45□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 FOXI1Q12951 378 aa7.45□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.45□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 C15orf56Q8N910 161 aa7.45□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.44□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 EPM2AB3EWF7 344 aa7.44□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 COX7A2LO14548 114 aa7.44□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 MT-ND6P03923 174 aa7.44□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 COX19Q49B96 90 aa7.44□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.44□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.44□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 DPH3Q96FX2 82 aa7.44□□□□□ -1.22
UBASH3B-208ENST00000533451 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.44□□□□□ -1.22
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