RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GUV1 79 aa5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIVA1O15304 175 aa5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MPV17L2Q567V2 206 aa5.81□□□□□ -1.48
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q8N3U1 123 aa5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.81□□□□□ -1.48
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BAALCQ8WXS3 180 aa5.8□□□□□ -1.48
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UPK3BQ9BT76 320 aa5.79□□□□□ -1.48
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.78□□□□□ -1.48
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PET117Q6UWS5 81 aa5.78□□□□□ -1.48
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AMELXQ99217 191 aa5.78□□□□□ -1.48
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 REG3AQ06141 175 aa5.77□□□□□ -1.49
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q9HAA7 133 aa5.75□□□□□ -1.49
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCL25O15444 150 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPM2O94777 84 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 XCL1P47992 114 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEC11AP67812 179 aa5.74□□□□□ -1.49
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC01545Q5VT33 79 aa5.74□□□□□ -1.49
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.73□□□□□ -1.49
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLC3P0DOY3 106 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLNP26678 52 aa5.73□□□□□ -1.49
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATOH7Q8N100 152 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf86A6NJI1 115 aa5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HERVK_113P63121 156 aa5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RMI2Q96E14 147 aa5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H3BRM9 83 aa5.71□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.71□□□□□ -1.5
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