RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529285.5

RPS3-213, Transcript of ribosomal protein S3, human

TSL 5

Gene RPS3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS3-213	ENST00000529285	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	COX11	Q9Y6N1	276 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	TRGC2	P03986	189 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	FA2H	Q7L5A8	372 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	LINC01546	A6NGU7	62 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	G0S2	P27469	103 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	LINC00614	P0C842	121 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RPS3-213	ENST00000529285	RAB5B	P61020	215 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285		A0A087WTM6	91 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285		Q6ZUT4	128 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	FAM104A	Q969W3	186 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	EREG	O14944	169 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	BAALC	Q8WXS3	180 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	TOMM6	Q96B49	74 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	PKD1	P98161	4303 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285		A0A1B0GVY2	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	SS18	Q15532	418 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	IGIP	A6NJ69	53 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS3-213	ENST00000529285	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	LINC01549	A6NIU2	74 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	BAGE3	Q86Y29	109 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	TMEM141	Q96I45	108 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	LECT2	O14960	151 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	CCL25	O15444	150 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	NPS	P0C0P6	89 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	XCL1	P47992	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	ERAS	Q7Z444	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	VCX2	Q9H322	139 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	WFDC2	Q14508	124 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285		Q6ZN92	141 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	TIMM17A	Q99595	171 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	IFITM10	A6NMD0	228 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	PMCHL1	Q16048	86 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285		A0A096LNJ9	63 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	HBD	P02042	147 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285		Q8N814	137 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS3-213	ENST00000529285	FOXI1	Q12951	378 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	AMELX	Q99217	191 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	USP17L23	D6RBM5	183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	KRTAP10-2	P60368	255 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST1H2BK	O60814	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HSBP1	O75506	76 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST1H2BO	P23527	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST1H2BB	P33778	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST1H2BD	P58876	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST1H2BC	P62807	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	C14orf177	Q52M58	125 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	SERF1A	O75920	110 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	CFAP161	Q6P656	301 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	UBE2D1	P51668	147 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RPS3-213	ENST00000529285	LINC00310	P59036	64 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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