RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512413.1

LVRN-208, Transcript of laeverin, human

TSL 2

Gene LVRN, Length 2,428 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LVRN-208	ENST00000512413	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	COX7A2L	O14548	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413		I3L2K1	104 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413		K7EIM0	57 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LVRN-208	ENST00000512413	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	IL4	P05112	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	BLCAP	P62952	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413		A6NDX4	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413		K7EMI3	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413		M0R378	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	LTA	P01374	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	LYZ	P61626	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	LCA10	Q71F78	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	ATOX1	O00244	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	TSHB	P01222	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	SLC25A20	O43772	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	REG3A	Q06141	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	ZNF56	Q15929	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	TRGV9	Q99603	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	NXPH4	O95158	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	NPY	P01303	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	NPC2	P61916	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413		H3BT86	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413		H3BVH4	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	FSHB	P01225	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413		K7EQD1	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	TRGV3	P03979	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	CXCL5	P42830	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	HERVK_113	P61574	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	AGRN	O00468	2067 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413		K7EQG2	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413		Q6YL49	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	CTSG	P08311	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413		Q6ZSN1	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LVRN-208	ENST00000512413	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.84	□□□□□ -1.64

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