RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 CREBBPQ92793 2442 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 SNURFQ9Y675 71 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 GPHB5Q86YW7 130 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 BSNQ9UPA5 3926 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 RMI2Q96E14 147 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 ZFHX3Q15911 3703 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 NXPH4O95158 308 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 NDPQ00604 133 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-217ENST00000510204 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.65□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A0J9YXY3 114 aa8.65□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 DNAL4O96015 105 aa8.65□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.65□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.65□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A0J9YX75 114 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A087WW49 117 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 C15orf32Q32M92 178 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 PRR9Q5T870 116 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 F5H697 171 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 TRBV12-3P01733 135 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 CACNA1AO00555 2505 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 DAD1P61803 113 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 KLKP1Q107X0 134 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 Q8N2B8 174 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV1-69P01742 117 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 APOC4P55056 127 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 LITAFQ99732 161 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 CENPEQ02224 2701 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF580Q9UK33 172 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A087WZ39 114 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 COX7A2LO14548 114 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 IGF1P05019 195 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 ECSCRQ19T08 205 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 GNRH2O43555 120 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.59□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.59□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A0J9YXV3 536 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 LINC00315P59091 139 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ACACBO00763 2458 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 SORL1Q92673 2214 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 Q9HAA7 133 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A087WWL8 130 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 MIAQ16674 131 aa8.56□□□□□ -1.04
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SH3BP2-217ENST00000510204 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 CCDC140Q96MF4 163 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 Q8N6K4 173 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ODF3BA8MYP8 253 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ENHOQ6UWT2 76 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 K7EMT4 169 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-217ENST00000510204 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.54□□□□□ -1.04
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