RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 LST1O00453 97 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 ENSAO43768 121 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 SPINK4O60575 86 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 TCL1BO95988 128 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 PPP1R17O96001 155 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 ARMS2P0C7Q2 107 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 P0C880 135 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 PYYP10082 97 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 DEFA4P12838 97 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 FCER1GP30273 86 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 PSMB2P49721 201 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 PRCDQ00LT1 54 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 KLKP1Q107X0 134 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 NNATQ16517 81 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM155Q4W5P6 130 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 C10orf113Q5VZT2 155 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 MIC13Q5XKP0 118 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 C2orf82Q6UX34 121 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 HRCT1Q6UXD1 115 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 Q6ZRU5 148 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 LINC00336Q6ZUF6 198 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 NDUFA11Q86Y39 141 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 WFDC5Q8TCV5 224 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 C10orf105Q8TEF2 133 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 DSCR8Q96T75 97 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 NABP2Q9BQ15 211 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 TM2D3Q9BRN9 247 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 SMIM2Q9BVW6 85 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 OTORQ9NRC9 128 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 PRO1854Q9UHT4 67 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 Q9Y3F1 56 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 ICOSQ9Y6W8 199 aa1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
PDE4D-211ENST00000504624 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 MGAQ8IWI9 3026 aa1.09□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TECTAO75443 2155 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 PKDREJQ9NTG1 2253 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 A0A0J9YW62 118 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 UPK2O00526 184 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CCL16O15467 120 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 NDUFB3O43676 98 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TIMM17BO60830 172 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 SH2D1AO60880 128 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 OXTP01178 125 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGKV1D-12P01611 117 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGHV1-69P01742 117 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 COX6B1P14854 86 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CKS2P33552 79 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 EFNA4P52798 201 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 BLCAPP62952 87 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 UBE2BP63146 152 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 RHOHQ15669 191 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF56Q15929 161 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 GDF5OSQ5U4N7 250 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 Q6ZQT7 251 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 MIR17HGQ75NE6 70 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 VMO1Q7Z5L0 202 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 C5orf38Q86SI9 138 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 Q8N8P6 123 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 DYNLRB2Q8TF09 96 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 BRK1Q8WUW1 75 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 DPH3Q96FX2 82 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 SLC50A1Q9BRV3 221 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 UPK3BQ9BT76 320 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM14CQ9P0S9 112 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 PKIGQ9Y2B9 76 aa1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 FRYQ5TBA9 3013 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 COL6A3P12111 3177 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 CHD7Q9P2D1 2997 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 WNK2Q9Y3S1 2297 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 A0A0J9YY99 117 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 IQCF6A8MYZ5 107 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 H0YGG7 62 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 H3BRN7 92 aa1.07□□□□□ -2.24
PDE4D-211ENST00000504624 COX7A2LO14548 114 aa1.07□□□□□ -2.24
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