RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 FGF6P10767 208 aa7.35□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.35□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 Q5VSD8 79 aa7.35□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.35□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.35□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM18Q96B42 140 aa7.35□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.35□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAT1Q14517 4588 aa7.35□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.34□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 A0A1B0GUV1 79 aa7.34□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 ATP6V1G1O75348 118 aa7.34□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.34□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.34□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.34□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 COX11Q9Y6N1 276 aa7.34□□□□□ -1.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.33□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ESDP10768 282 aa7.33□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 REG3AQ06141 175 aa7.33□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ENHOQ6UWT2 76 aa7.33□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.33□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 MIAQ16674 131 aa7.32□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 Q8N8P6 123 aa7.32□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.32□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.31□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRSS47A8MTI9 375 aa7.31□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRR34Q9NV39 138 aa7.31□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 J3QL48 77 aa7.3□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.3□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 A0A087WTM6 91 aa7.29□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.29□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 LECT2O14960 151 aa7.29□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.29□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 BAALCQ8WXS3 180 aa7.29□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 YPEL4Q96NS1 127 aa7.29□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.29□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 K7EMI3 77 aa7.28□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 SCO1O75880 301 aa7.28□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 G0S2P27469 103 aa7.28□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 XGP55808 180 aa7.28□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 FA2HQ7L5A8 372 aa7.28□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.28□□□□□ -1.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 SS18Q15532 418 aa7.27□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.27□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.27□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.27□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.26□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.25□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.25□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.25□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.25□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 XCL1P47992 114 aa7.25□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 Q6ZUT4 128 aa7.25□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 Q8N814 137 aa7.25□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.25□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.24□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 CCL25O15444 150 aa7.24□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRGC2P03986 189 aa7.24□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 RAB5BP61020 215 aa7.24□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 C14orf177Q52M58 125 aa7.24□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 Q6ZN92 141 aa7.24□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.24□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.24□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 IFITM10A6NMD0 228 aa7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 COLCA2A8K830 154 aa7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP17L23D6RBM5 183 aa7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 LINC00614P0C842 121 aa7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 WFDC2Q14508 124 aa7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM141Q96I45 108 aa7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 VCX2Q9H322 139 aa7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.23□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAM229AH3BQW9 127 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 KRTAP10-1P60331 282 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 CFAP161Q6P656 301 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 BAGE3Q86Y29 109 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 TOMM6Q96B49 74 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.22□□□□□ -1.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms