RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494876.1

TBXAS1-220, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TBXAS1, Length 502 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-220ENST00000494876 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
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TBXAS1-220ENST00000494876 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa3.03□□□□□ -1.92
TBXAS1-220ENST00000494876 A0A1B0GU33 70 aa3.03□□□□□ -1.92
TBXAS1-220ENST00000494876 A0A1W2PNM2 257 aa3.03□□□□□ -1.92
TBXAS1-220ENST00000494876 LINC01549A6NIU2 74 aa3.03□□□□□ -1.92
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TBXAS1-220ENST00000494876 LRRC37A3O60309 1634 aa3.03□□□□□ -1.92
TBXAS1-220ENST00000494876 DUOX1Q9NRD9 1551 aa3.03□□□□□ -1.92
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TBXAS1-220ENST00000494876 LINC00167Q96N53 147 aa3.02□□□□□ -1.93
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TBXAS1-220ENST00000494876 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.01□□□□□ -1.93
TBXAS1-220ENST00000494876 CSAG1Q6PB30 78 aa3.01□□□□□ -1.93
TBXAS1-220ENST00000494876 LMO7Q8WWI1 1683 aa3.01□□□□□ -1.93
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TBXAS1-220ENST00000494876 H7C423 109 aa3□□□□□ -1.93
TBXAS1-220ENST00000494876 NDUFB1O75438 58 aa3□□□□□ -1.93
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TBXAS1-220ENST00000494876 ZNF563Q8TA94 476 aa3□□□□□ -1.93
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TBXAS1-220ENST00000494876 FAM168BA1KXE4 195 aa2.99□□□□□ -1.93
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TBXAS1-220ENST00000494876 CYYR1Q96J86 154 aa2.99□□□□□ -1.93
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TBXAS1-220ENST00000494876 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa2.97□□□□□ -1.93
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TBXAS1-220ENST00000494876 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.97□□□□□ -1.93
TBXAS1-220ENST00000494876 FCER1GP30273 86 aa2.97□□□□□ -1.93
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TBXAS1-220ENST00000494876 Q9BRP9 147 aa2.97□□□□□ -1.93
TBXAS1-220ENST00000494876 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
TBXAS1-220ENST00000494876 PCDH15Q96QU1 1955 aa2.97□□□□□ -1.93
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TBXAS1-220ENST00000494876 KRTAP10-9P60411 292 aa2.96□□□□□ -1.94
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TBXAS1-220ENST00000494876 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.96□□□□□ -1.94
TBXAS1-220ENST00000494876 PRR34Q9NV39 138 aa2.96□□□□□ -1.94
TBXAS1-220ENST00000494876 NRAPQ86VF7 1730 aa2.96□□□□□ -1.94
TBXAS1-220ENST00000494876 SDK2Q58EX2 2172 aa2.95□□□□□ -1.94
TBXAS1-220ENST00000494876 FREM3P0C091 2139 aa2.95□□□□□ -1.94
TBXAS1-220ENST00000494876 A0A087WVE0 104 aa2.95□□□□□ -1.94
TBXAS1-220ENST00000494876 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.95□□□□□ -1.94
TBXAS1-220ENST00000494876 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TBXAS1-220ENST00000494876 SPTBP11277 2137 aa2.95□□□□□ -1.94
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