RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491889.5

GLIS3-217, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 797 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-217ENST00000491889 TMEM18Q96B42 140 aa13.59□□□□□ -0.23
GLIS3-217ENST00000491889 DNAH11Q96DT5 4516 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 RPL39P62891 51 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 FABP9Q0Z7S8 132 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 SMAGPQ0VAQ4 97 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 Q8N814 137 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 SMCO4Q9NRQ5 59 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 C16orf90A8MZG2 172 aa13.56□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 ZNF664Q8N3J9 261 aa13.56□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa13.56□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 PKHD1P08F94 4074 aa13.55□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 Q6ZUT4 128 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 BIRC6Q9NR09 4857 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 K7EMI3 77 aa13.53□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 CDPF1Q6NVV7 123 aa13.53□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 SPANXA1Q9NS26 97 aa13.53□□□□□ -0.24
GLIS3-217ENST00000491889 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa13.52□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 ORMDL2Q53FV1 153 aa13.52□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 USP17L23D6RBM5 183 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 FAM104AQ969W3 186 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 GAGE12HA6NDE8 117 aa13.5□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa13.5□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 C2orf66Q6UXQ4 117 aa13.49□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 CYSLTR1Q9Y271 337 aa13.49□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa13.48□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa13.48□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 CCL25O15444 150 aa13.47□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 SS18Q15532 418 aa13.47□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 C14orf177Q52M58 125 aa13.47□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.47□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 LINC01546A6NGU7 62 aa13.46□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 XCL1P47992 114 aa13.46□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 FOXI1Q12951 378 aa13.46□□□□□ -0.25
GLIS3-217ENST00000491889 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa13.45□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.45□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 FA2HQ7L5A8 372 aa13.44□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 C1orf196B1AJZ1 125 aa13.43□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 PRSS1P07477 247 aa13.43□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 G0S2P27469 103 aa13.43□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 CD164L2Q6UWJ8 174 aa13.43□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 IGIPA6NJ69 53 aa13.42□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 GCSHP23434 173 aa13.42□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 KRTAP10-1P60331 282 aa13.42□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 C15orf56Q8N910 161 aa13.42□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 TOMM6Q96B49 74 aa13.42□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa13.42□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 TMEM141Q96I45 108 aa13.42□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 DNAH5Q8TE73 4624 aa13.41□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 IFITM10A6NMD0 228 aa13.41□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 COLCA2A8K830 154 aa13.41□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 SCO1O75880 301 aa13.41□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 NPSP0C0P6 89 aa13.4□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 AP5S1Q9NUS5 200 aa13.4□□□□□ -0.26
GLIS3-217ENST00000491889 TIMM17AQ99595 171 aa13.39□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 hDV102S1A0JD36 115 aa13.38□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 TRGC2P03986 189 aa13.38□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 LINC00614P0C842 121 aa13.38□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.38□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 CFAP161Q6P656 301 aa13.38□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 Q6ZN92 141 aa13.38□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.38□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.38□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 LRP1BQ9NZR2 4599 aa13.38□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 ERASQ7Z444 233 aa13.37□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 AMELXQ99217 191 aa13.37□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 LINC01549A6NIU2 74 aa13.36□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 LINC01620Q4KN68 170 aa13.36□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 HIGD2BQ4VC39 106 aa13.36□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.36□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 VCX2Q9H322 139 aa13.36□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 A0A096LNJ9 63 aa13.35□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa13.35□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 COX7A2LO14548 114 aa13.35□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 RAB5BP61020 215 aa13.35□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.35□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 CDK2AP2O75956 126 aa13.34□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 UBE2D1P51668 147 aa13.34□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa13.34□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 C5orf38Q86SI9 138 aa13.34□□□□□ -0.27
GLIS3-217ENST00000491889 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa13.33□□□□□ -0.28
GLIS3-217ENST00000491889 SLPIP03973 132 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms