RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489756.1

DTNB-223, Transcript of dystrobrevin beta, human

TSL 4

Gene DTNB, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DTNB-223	ENST00000489756	TIRAP	P58753	221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	FOXI1	Q12951	378 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	MIA	Q16674	131 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	NDUFA1	O15239	70 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	TIMM17B	O60830	172 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	INSL3	P51460	131 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756		Q6ZTI0	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756		A8MZ25	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756		M0QXV9	152 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	HERVK_113	P63121	156 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	GAGE4	Q13068	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	GAGE5	Q13069	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	ACACB	O00763	2458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	AGRN	O00468	2067 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	FBN2	P35556	2912 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756		C9JAW5	83 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	SLC25A20	O43772	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	PRSS2	P07478	247 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	IFITM1	P13164	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	RNF183	Q96D59	192 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	POLQ	O75417	2590 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	UBE2L6	O14933	153 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	TRIAP1	O43715	76 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	GAGE7	O76087	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	NPC2	P61916	151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	COX6A2	Q02221	97 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.71	□□□□□ -1.65
DTNB-223	ENST00000489756	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	CIDEA	O60543	219 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	NDUFA7	O95182	113 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756		Q9H8V8	135 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DTNB-223	ENST00000489756	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66

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