RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.18□□□□□ -1.1
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RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 MYCBP2O75592 4640 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 A6NJY4 79 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 SMKR1H3BMG3 65 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-207ENST00000484547 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-207ENST00000484547 MTURNQ8N3F0 131 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-207ENST00000484547 C18orf15Q96N68 181 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 H3BMG7 143 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 GAGE13Q4V321 117 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 NXPH4O95158 308 aa8.13□□□□□ -1.11
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RABGEF1-207ENST00000484547 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 C16orf74Q96GX8 76 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2D1P51668 147 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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RABGEF1-207ENST00000484547 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGEF1-207ENST00000484547 PRAC2D3DTV9 90 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-207ENST00000484547 GAS8-AS1O95177 125 aa8.1□□□□□ -1.11
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RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM141Q96I45 108 aa8.09□□□□□ -1.11
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RABGEF1-207ENST00000484547 K7ERJ3 54 aa8.08□□□□□ -1.12
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RABGEF1-207ENST00000484547 GAGE12IP0CL82 117 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 HERVK_113P61574 105 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 RASL10AQ92737 203 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 TIMM17AQ99595 171 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 ASIPP42127 132 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 FOXI1Q12951 378 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 Q5VSD8 79 aa8.07□□□□□ -1.12
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RABGEF1-207ENST00000484547 BAALCQ8WXS3 180 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 XGP55808 180 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-207ENST00000484547 C11orf86A6NJI1 115 aa8.05□□□□□ -1.12
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