RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481600.5

EDRF1-208, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene EDRF1, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-208ENST00000481600 CLEC2BQ92478 149 aa8.73□□□□□ -1.01
EDRF1-208ENST00000481600 ZZEF1O43149 2961 aa8.73□□□□□ -1.01
EDRF1-208ENST00000481600 XGP55808 180 aa8.73□□□□□ -1.01
EDRF1-208ENST00000481600 PRR9Q5T870 116 aa8.73□□□□□ -1.01
EDRF1-208ENST00000481600 ATRQ13535 2644 aa8.72□□□□□ -1.01
EDRF1-208ENST00000481600 DSCR8Q96T75 97 aa8.72□□□□□ -1.01
EDRF1-208ENST00000481600 TACC2O95359 2948 aa8.72□□□□□ -1.01
EDRF1-208ENST00000481600 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.72□□□□□ -1.01
EDRF1-208ENST00000481600 C16orf74Q96GX8 76 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 CITED1Q99966 193 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 TMEM126AQ9H061 195 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 KALRNO60229 2985 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 K7EQG2 157 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 COX7B2Q8TF08 81 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 DEFB4AO15263 64 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 TMEM89A2RUT3 159 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 LGALS9O00182 355 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 TCL1BO95988 128 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 Q9HAA7 133 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 H0YGX0 51 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 COX7A2LO14548 114 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 LECT2O14960 151 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 A0A0J9YXY3 114 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 Q6ZTI0 123 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 AGRNO00468 2067 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 LRBAP50851 2863 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 ACYP1P07311 99 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 ATP5G1P05496 136 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 H3BT86 120 aa8.66□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 DEFB135Q30KP9 77 aa8.66□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 USP24Q9UPU5 2620 aa8.66□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 NFE4Q86UQ8 179 aa8.66□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.66□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.66□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.66□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 IGHV3-30P01768 117 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 IGHV3-33P01772 117 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 TRACP01848 142 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 M0QY20 66 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 PROK1P58294 105 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 CDIP1Q9H305 208 aa8.65□□□□□ -1.02
EDRF1-208ENST00000481600 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.65□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.65□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.65□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 MIAQ16674 131 aa8.64□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 Q6ZS46 218 aa8.64□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.64□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 MAST4O15021 2626 aa8.64□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 KLK12Q9UKR0 248 aa8.64□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 A0A0B4J2C4 111 aa8.63□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.63□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 MRAPQ8TCY5 172 aa8.63□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 CCDC179H3BU77 68 aa8.63□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.63□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 BRI3O95415 125 aa8.63□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.62□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 CDK2AP2O75956 126 aa8.62□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.62□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 PRM2P04554 102 aa8.62□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 ODF3Q96PU9 254 aa8.62□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.62□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 A0A1B0GX51 115 aa8.62□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 hADV29S1A0JD25 119 aa8.62□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.62□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 PRO0255Q9UI72 69 aa8.62□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 A8MZ25 164 aa8.61□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 BSNQ9UPA5 3926 aa8.61□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.61□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 SPAG11BQ08648 103 aa8.61□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 TMEM223A0PJW6 202 aa8.6□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 KLLNB2CW77 178 aa8.6□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 PRO0461Q9UI25 63 aa8.6□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 IGLV1-40P01703 118 aa8.59□□□□□ -1.03
EDRF1-208ENST00000481600 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms