RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 C20orf78Q9BR46 151 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 USP17L23D6RBM5 183 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 SNAPINO95295 136 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 HLA-DQA1P01909 254 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 REG3AQ06141 175 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 ORMDL3Q8N138 153 aa15.6■□□□□ 0.09
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PTPRD-210ENST00000481079 C14orf177Q52M58 125 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRD-210ENST00000481079 INAFM2P0DMQ5 153 aa15.58■□□□□ 0.08
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PTPRD-210ENST00000481079 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
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PTPRD-210ENST00000481079 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
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PTPRD-210ENST00000481079 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRD-210ENST00000481079 LINC00528Q8N1L1 170 aa15.48■□□□□ 0.07
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PTPRD-210ENST00000481079 C15orf56Q8N910 161 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRD-210ENST00000481079 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRD-210ENST00000481079 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15.4■□□□□ 0.06
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PTPRD-210ENST00000481079 CFAP161Q6P656 301 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRD-210ENST00000481079 Q6ZUT4 128 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRD-210ENST00000481079 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRD-210ENST00000481079 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRD-210ENST00000481079 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRD-210ENST00000481079 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRD-210ENST00000481079 CCL25O15444 150 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRD-210ENST00000481079 XCL1P47992 114 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRD-210ENST00000481079 C2orf66Q6UXQ4 117 aa15.3■□□□□ 0.04
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