RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466020.1

CLHC1-211, Transcript of clathrin heavy chain linker domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene CLHC1, Length 153 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1-211ENST00000466020 ARHGEF10O15013 1369 aa-1.24□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 SBF2Q86WG5 1849 aa-1.24□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 KNL1Q8NG31 2342 aa-1.24□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 MYH8P13535 1937 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 NWD2Q9ULI1 1742 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 S100A7L2Q5SY68 101 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 SAMD13Q5VXD3 122 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TRIQKQ629K1 86 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 CHMP6Q96FZ7 201 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 PCBD2Q9H0N5 130 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 ATPIF1Q9UII2 106 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 RELNP78509 3460 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 ROCK1Q13464 1354 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 DAPK1P53355 1430 aa-1.25□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 A0A0C4DFX4 3053 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 MYH13Q9UKX3 1938 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 A6NIN4 97 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TNFSF15O95150 251 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 NCR2O95944 276 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 COX17Q14061 63 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TMEM128Q5BJH2 165 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 Q6AWC8 147 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 V9GYH0 126 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 ADAMTS12P58397 1594 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 FMN2Q9NZ56 1722 aa-1.26□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-1.27□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-1.27□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-1.27□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 CBLN1P23435 193 aa-1.27□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 G0S2P27469 103 aa-1.27□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 CCL8P80075 99 aa-1.27□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-1.27□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 HIGD1AQ9Y241 93 aa-1.27□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-1.27□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 IL5P05113 134 aa-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 TCTE3Q8IZS6 198 aa-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 NAA60Q9H7X0 242 aa-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 LENEPQ9Y5L5 61 aa-1.28□□□□□ -2.61
CLHC1-211ENST00000466020 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.28□□□□□ -2.613e-21■■■■■ 78.4
CLHC1-211ENST00000466020 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 TRIOO75962 3097 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 A0A1B0GX51 115 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 SIX6O95475 246 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 SCTP09683 121 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 COX8AP10176 69 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 CMPK1P30085 196 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 GNG10P50151 68 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 Q6ZUT4 128 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 BAGE2Q86Y30 109 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 SEC11CQ9BY50 192 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 NBEAQ8NFP9 2946 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 COL4A6Q14031 1691 aa-1.29□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 IFT140Q96RY7 1462 aa-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 HCG22E2RYF7 251 aa-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 UQCR11O14957 56 aa-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 IFNGP01579 166 aa-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 C10orf128Q5T292 105 aa-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 SAR1AQ9NR31 198 aa-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 SMPXQ9UHP9 88 aa-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 SLIT1O75093 1534 aa-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 DISP2A7MBM2 1401 aa-1.31□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-1.31□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-1.31□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 PBRM1Q86U86 1689 aa-1.31□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 F8VRH5 84 aa-1.31□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 NCS1P62166 190 aa-1.31□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-1.31□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 BTAF1O14981 1849 aa-1.31□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 ACACAQ13085 2346 aa-1.32□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-1.32□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-1.32□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 IGLC7A0M8Q6 106 aa-1.32□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 SNCGO76070 127 aa-1.32□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 S100GP29377 79 aa-1.32□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 ALX1Q15699 326 aa-1.32□□□□□ -2.62
CLHC1-211ENST00000466020 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-1.32□□□□□ -2.62
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