RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.27□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 PRSS47A8MTI9 375 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 H7C423 109 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6ZUT4 128 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8N8P6 123 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 TM2D2Q9BX73 214 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 Q0VG73 95 aa7.25□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 MIAQ16674 131 aa7.25□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.25□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.25□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.25□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.25□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.25□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 RAB5AP20339 215 aa7.24□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.24□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.24□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8N814 137 aa7.24□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 RMI2Q96E14 147 aa7.24□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.24□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.23□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 C16orf90A8MZG2 172 aa7.23□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 MT-ND6P03923 174 aa7.23□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 COX19Q49B96 90 aa7.23□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC01620Q4KN68 170 aa7.23□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.23□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM101Q96IK0 257 aa7.23□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.22□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 USP17L23D6RBM5 183 aa7.22□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 XCL1P47992 114 aa7.22□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.22□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.21□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 COLCA2A8K830 154 aa7.21□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 CCL25O15444 150 aa7.21□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP10-1P60331 282 aa7.21□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.21□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.21□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.21□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.21□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.2□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.2□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 EREGO14944 169 aa7.2□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 PRSS1P07477 247 aa7.2□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 FOXI1Q12951 378 aa7.2□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.2□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 COX11Q9Y6N1 276 aa7.2□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.19□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.19□□□□□ -1.26
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RPRD1B-202ENST00000449186 PMCHL1Q16048 86 aa7.19□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM18Q96B42 140 aa7.19□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.19□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A096LNJ9 63 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC01546A6NGU7 62 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 IGIPA6NJ69 53 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 SLPIP03973 132 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 HAMPP81172 84 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 FA2HQ7L5A8 372 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 C15orf56Q8N910 161 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.18□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 SS18Q15532 418 aa7.17□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.17□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.17□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.16□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 IFITM10A6NMD0 228 aa7.16□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 COX6A2Q02221 97 aa7.16□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 C5orf38Q86SI9 138 aa7.16□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 TOMM6Q96B49 74 aa7.16□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM141Q96I45 108 aa7.16□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.16□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 hDV102S1A0JD36 115 aa7.15□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 K7EMI3 77 aa7.15□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP6V1G1O75348 118 aa7.15□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00614P0C842 121 aa7.15□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 GCSHP23434 173 aa7.15□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE2CQ5TA81 110 aa7.15□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.15□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.15□□□□□ -1.26
RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.14□□□□□ -1.27
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00310P59036 64 aa7.14□□□□□ -1.27
RPRD1B-202ENST00000449186 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.14□□□□□ -1.27
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.14□□□□□ -1.27
RPRD1B-202ENST00000449186 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.14□□□□□ -1.27
RPRD1B-202ENST00000449186 AMELXQ99217 191 aa7.14□□□□□ -1.27
RPRD1B-202ENST00000449186 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.14□□□□□ -1.27
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