RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437188.1

RPSAP28-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP28, Length 874 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP28-201ENST00000437188 AGRNO00468 2067 aa7.22□□□□□ -1.25
RPSAP28-201ENST00000437188 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.21□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.21□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.21□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 A0A0B4J2C4 111 aa7.2□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 IGHV3-30P01768 117 aa7.2□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.2□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 EMP1P54849 157 aa7.2□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.2□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.2□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 A0A0J9YXV3 536 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 TIMM17BO60830 172 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 APOMO95445 188 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 AZU1P20160 251 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 TIRAPP58753 221 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 C16orf74Q96GX8 76 aa7.19□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 COL7A1Q02388 2944 aa7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 IFITM1P13164 125 aa7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 HERVK_113P63121 156 aa7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 RNF183Q96D59 192 aa7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 XCL2Q9UBD3 114 aa7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 ERG28Q9UKR5 140 aa7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.18□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 A0A0J9YXY3 114 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 H3BMG7 143 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 H7C423 109 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 TSPAN13O95857 204 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 UBE2D3P61077 147 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 UBE2D2P62837 147 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 IL17DQ8TAD2 202 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 SPANXCQ9NY87 97 aa7.17□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 A0A1W2PRX2 142 aa7.16□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 K7EQD1 137 aa7.16□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 M0QXV9 152 aa7.16□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 SAP30O75446 220 aa7.16□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 PSMB2P49721 201 aa7.16□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.16□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 TMEM101Q96IK0 257 aa7.16□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.16□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.16□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.15□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 COX6CP09669 75 aa7.15□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 CFC1BP0CG36 223 aa7.15□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 CFC1P0CG37 223 aa7.15□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.15□□□□□ -1.26
RPSAP28-201ENST00000437188 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 A4D1N5 150 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 NACAE9PAV3 2078 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 UBE2L6O14933 153 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 SCGB1A1P11684 91 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 WFDC2Q14508 124 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 MIAQ16674 131 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 Q1RN00 199 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.14□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 TENM3Q9P273 2699 aa7.13□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 NDUFA1O15239 70 aa7.13□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 IGLV1-51P01701 117 aa7.13□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 HERV-K104P63124 156 aa7.13□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 ATXN8Q156A1 80 aa7.13□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 Q6ZUT4 128 aa7.13□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.13□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.13□□□□□ -1.27
RPSAP28-201ENST00000437188 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms