RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409627.6

SUMO1-208, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 722 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-208	ENST00000409627	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	HIST1H2BO	P23527	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	HIST1H2BB	P33778	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	HIST1H2BD	P58876	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	HIST1H2BC	P62807	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	REG3A	Q06141	175 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	BAGE3	Q86Y29	109 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	TOMM6	Q96B49	74 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUMO1-208	ENST00000409627	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	MIA	Q16674	131 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627		Q9HAA7	133 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	RYR3	Q15413	4870 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	NPS	P0C0P6	89 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627		Q6ZUT4	128 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	FAM104A	Q969W3	186 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	RMI2	Q96E14	147 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627		A0A096LNJ9	63 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	HBD	P02042	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	RTL8C	O15255	209 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	SERF1A	O75920	110 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	LINC00310	P59036	64 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	COX11	Q9Y6N1	276 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	HSBP1	O75506	76 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	PMCHL1	Q16048	86 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	ERAS	Q7Z444	233 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	TMEM141	Q96I45	108 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SUMO1-208	ENST00000409627	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627		Q6ZN92	141 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	DNAH2	Q9P225	4427 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	CCL25	O15444	150 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	AMELX	Q99217	191 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	PSCA	O43653	123 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	NUPR1	O60356	82 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	SS18	Q15532	418 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	IFITM10	A6NMD0	228 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	ATP5L	O75964	103 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	VCX2	Q9H322	139 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	BAALC	Q8WXS3	180 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		11.02	□□□□□ -0.64
SUMO1-208	ENST00000409627	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	NDUFA6	P56556	154 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	TNP2	Q05952	138 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	XCL1	P47992	114 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	UBE2D1	P51668	147 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	FOXI1	Q12951	378 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	PMVK	Q15126	192 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	LEPROTL1	O95214	131 aa		11	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		11	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627		A0A087WTM6	91 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	CST9L	Q9H4G1	147 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	SEC11A	P67812	179 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	WFDC2	Q14508	124 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	EREG	O14944	169 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SUMO1-208	ENST00000409627	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SUMO1-208	ENST00000409627		A0A0J9YXV3	536 aa		10.95	□□□□□ -0.66

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