RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 GAGE12BA1L429 117 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 GAGE7O76087 117 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 GAGE12FP0CL80 117 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 GAGE12GP0CL81 117 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 GAGE12IP0CL82 117 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 MIFP14174 115 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 DEFA6Q01524 100 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 PMVKQ15126 192 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
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C6orf48-208ENST00000395788 Q8NAQ8 132 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 AMELXQ99217 191 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 CST9LQ9H4G1 147 aa4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.24□□□□□ -1.73
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C6orf48-208ENST00000395788 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.23□□□□□ -1.73
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C6orf48-208ENST00000395788 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 DEFB135Q30KP9 77 aa4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 NFE4Q86UQ8 179 aa4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 OR11H2Q8NH07 326 aa4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.23□□□□□ -1.73
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C6orf48-208ENST00000395788 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 H7C423 109 aa4.22□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 SIVA1O15304 175 aa4.22□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.22□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.22□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.22□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.22□□□□□ -1.73
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.21□□□□□ -1.74
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C6orf48-208ENST00000395788 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.21□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 GAGE12JA6NER3 117 aa4.21□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 C11orf86A6NJI1 115 aa4.21□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 M0R143 59 aa4.21□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 GAGE1Q13065 139 aa4.21□□□□□ -1.74
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C6orf48-208ENST00000395788 GAGE5Q13069 117 aa4.21□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 GAGE13Q4V321 117 aa4.21□□□□□ -1.74
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C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.21□□□□□ -1.74
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C6orf48-208ENST00000395788 DEFB130AP0DP74 79 aa4.2□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 EMP1P54849 157 aa4.2□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.2□□□□□ -1.74
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C6orf48-208ENST00000395788 HIGD1BQ9P298 99 aa4.2□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 PRO0255Q9UI72 69 aa4.2□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
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C6orf48-208ENST00000395788 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.19□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
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C6orf48-208ENST00000395788 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.19□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 LCE1EQ5T753 118 aa4.19□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 Q6ZUT4 128 aa4.19□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.19□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM243Q9BU79 118 aa4.19□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.19□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 CELA1Q9UNI1 258 aa4.19□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 COL6A5A8TX70 2615 aa4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0J9YXV3 536 aa4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM223A0PJW6 202 aa4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 ATP5G1P05496 136 aa4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 GYPEP15421 78 aa4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 NMUP48645 174 aa4.18□□□□□ -1.74
C6orf48-208ENST00000395788 UBE2D1P51668 147 aa4.18□□□□□ -1.74
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