RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.91□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 A6NDN8 102 aa7.91□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 H3BS24 57 aa7.91□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 DEFB135Q30KP9 77 aa7.91□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.91□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.9□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 H7C423 109 aa7.9□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 DEFB130BP0DP73 79 aa7.9□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 DEFB130AP0DP74 79 aa7.9□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 MIFP14174 115 aa7.9□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 FHL2Q14192 279 aa7.9□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 TAL2Q16559 108 aa7.9□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.9□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CTXN3-202ENST00000395322 UBE2L6O14933 153 aa7.89□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.89□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM243Q9BU79 118 aa7.89□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.89□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.88□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF815PA8K554 130 aa7.88□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.88□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 A0A0J9YXV3 536 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM223A0PJW6 202 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 Q6ZUT4 128 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 RNF183Q96D59 192 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM101Q96IK0 257 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 LEPROTO15243 131 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 LINC00694P0DN24 101 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 PRO0255Q9UI72 69 aa7.87□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 VWFP04275 2813 aa7.86□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 A8MZ25 164 aa7.86□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 H3BRM9 83 aa7.86□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 J3QQQ9 107 aa7.86□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 DAD1P61803 113 aa7.86□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.86□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 FAM104AQ969W3 186 aa7.86□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 COX11Q9Y6N1 276 aa7.86□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.85□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.85□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 GCSHP23434 173 aa7.85□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 UBE2D1P51668 147 aa7.85□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 HERVK_113P63121 156 aa7.85□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 CEND1Q8N111 149 aa7.85□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 Q8NAQ8 132 aa7.85□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 HIST1H4GQ99525 98 aa7.85□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 TM2D2Q9BX73 214 aa7.85□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.84□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.84□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 GYPEP15421 78 aa7.84□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 PTTG1IPP53801 180 aa7.84□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 TIRAPP58753 221 aa7.84□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.84□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.84□□□□□ -1.15
CTXN3-202ENST00000395322 ATP5G1P05496 136 aa7.83□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.83□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.83□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.82□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.82□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 TAX1BP3O14907 124 aa7.82□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.82□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP10-11P60412 298 aa7.81□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.81□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 SMIM13P0DJ93 91 aa7.81□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.81□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 FXYD2P54710 66 aa7.81□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.81□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.81□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.81□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.8□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.8□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 A0A0J9YY99 117 aa7.8□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM238C9JI98 176 aa7.8□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 DEFB4AO15263 64 aa7.8□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.8□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 C9orf118A6NHY6 69 aa7.79□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.79□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 GAGE6Q13070 117 aa7.79□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.79□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
CTXN3-202ENST00000395322 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.78□□□□□ -1.16
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