RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CASP4-201ENST00000393150 ARL16Q0P5N6 197 aa4.97□□□□□ -1.61
CASP4-201ENST00000393150 PYY3Q5JQD4 70 aa4.97□□□□□ -1.61
CASP4-201ENST00000393150 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CASP4-201ENST00000393150 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CASP4-201ENST00000393150 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.97□□□□□ -1.61
CASP4-201ENST00000393150 NPCDR1Q9BY65 106 aa4.97□□□□□ -1.61
CASP4-201ENST00000393150 PARLQ9H300 379 aa4.97□□□□□ -1.61
CASP4-201ENST00000393150 H7C1H1 209 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 ZNF726P1Q15940 193 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 IQCJQ1A5X6 159 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 OTORQ9NRC9 128 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.96□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 A0A1W2PPV4 95 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 XKRY2A2RUG3 117 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 GZMBP10144 247 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 DDTP30046 118 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 UBE2V1Q13404 147 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 MAJINQ3KP22 176 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 ENHOQ6UWT2 76 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.95□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 IFITM10A6NMD0 228 aa4.94□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 CXorf1O96002 111 aa4.94□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 COX19Q49B96 90 aa4.94□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.94□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 Q6ZRP5 223 aa4.94□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.94□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 FXYD5Q96DB9 178 aa4.94□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 C9orf85Q96MD7 179 aa4.94□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 PANO1I0J062 215 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 P01737 135 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 MT-ND6P03923 174 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 LINC00694P0DN24 101 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 CACNG7P62955 275 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 STPG4Q8N801 248 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.93□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 CHTF8P0CG12 524 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 GAGE2BQ13066 116 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 PRR4Q16378 134 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 GAGE2EQ4V326 116 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 CST9LP1Q5W188 147 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 LINC01551Q86U37 167 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 C11orf52Q96A22 123 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 SFRP2Q96HF1 295 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.92□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 COX6A2Q02221 97 aa4.91□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 MPV17L2Q567V2 206 aa4.91□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 C14orf144Q96I85 54 aa4.91□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.91□□□□□ -1.62
CASP4-201ENST00000393150 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 STAG3L2P0CL84 134 aa4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 STAG3L3P0CL85 134 aa4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 UBE2D3P61077 147 aa4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 UBE2D2P62837 147 aa4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 IL36BQ9NZH7 164 aa4.9□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 RAB4AP20338 218 aa4.89□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 GCHFRP30047 84 aa4.89□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 GNG4P50150 75 aa4.89□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 REG3AQ06141 175 aa4.89□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.89□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 PRNTQ86SH4 94 aa4.89□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.89□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 PRR34Q9NV39 138 aa4.89□□□□□ -1.63
CASP4-201ENST00000393150 MUC2Q02817 5179 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms