RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 CELA1Q9UNI1 258 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF815PA8K554 130 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 GYPEP15421 78 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 DAD1P61803 113 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 A8MZ25 164 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 UBE2L6O14933 153 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 PRO0255Q9UI72 69 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 UBE2D1P51668 147 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 SEC11AP67812 179 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 G3V4G9 280 aa8.72□□□□□ -1.01
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ZNF548-201ENST00000336128 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 H7C423 109 aa8.72□□□□□ -1.01
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ZNF548-201ENST00000336128 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 J3QQQ9 107 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 GCSHP23434 173 aa8.71□□□□□ -1.01
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ZNF548-201ENST00000336128 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 RETNQ9HD89 108 aa8.71□□□□□ -1.01
ZNF548-201ENST00000336128 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 TAX1BP3O14907 124 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 GAGE6Q13070 117 aa8.71□□□□□ -1.02
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ZNF548-201ENST00000336128 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 ATP5G1P05496 136 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 TIRAPP58753 221 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 TAL2Q16559 108 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0J9YY99 117 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 A6NDN8 102 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 COX11Q9Y6N1 276 aa8.69□□□□□ -1.02
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ZNF548-201ENST00000336128 FXYD2P54710 66 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 CEND1Q8N111 149 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 HIST1H4GQ99525 98 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.68□□□□□ -1.02
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ZNF548-201ENST00000336128 COX6A2Q02221 97 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 TM2D2Q9BX73 214 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 A0A096LPF7 62 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 K7EP13 123 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 HTN3P15516 51 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 HERVK_113P63121 156 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.66□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 H3BRM9 83 aa8.66□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 PTTG1IPP53801 180 aa8.66□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.66□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF548-201ENST00000336128 C12orf74Q32Q52 190 aa8.65□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 STAB1Q9NY15 2570 aa8.64□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 SMIM13P0DJ93 91 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.038e-6■■□□□ 11.7
ZNF548-201ENST00000336128 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 RAB37Q96AX2 223 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM262E9PQX1 116 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 K7ERJ3 54 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0J9YXY3 114 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 C9orf118A6NHY6 69 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 RBX1P62877 108 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1B0GUV1 79 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV3-30P01768 117 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.6□□□□□ -1.03
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