RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.98□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.97□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GAGE12JA6NER3 117 aa7.97□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 SMIM13P0DJ93 91 aa7.97□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GAGE4Q13068 117 aa7.97□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GAGE5Q13069 117 aa7.97□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 GAGE13Q4V321 117 aa7.97□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.97□□□□□ -1.13
PGA3-201ENST00000325558 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.96□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 H7C423 109 aa7.96□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 C12orf74Q32Q52 190 aa7.96□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.96□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.95□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 HIST1H4GQ99525 98 aa7.95□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.95□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 PTTG1IPP53801 180 aa7.95□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 VAMP3Q15836 100 aa7.95□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 F8P00451 2351 aa7.94□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3-30P01768 117 aa7.94□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.94□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.94□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.94□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.94□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.94□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.93□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 A0A1W2PPM0 123 aa7.93□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 LYRM9A8MSI8 78 aa7.93□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 H3BUT2 72 aa7.93□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 K7ERJ3 54 aa7.93□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 COX6A2Q02221 97 aa7.93□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.93□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 IGLL5B9A064 214 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 APOC4P55056 127 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 LITAFQ99732 161 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 TMEM243Q9BU79 118 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 ATRQ13535 2644 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 Q8NAQ8 132 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 RAB37Q96AX2 223 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.92□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.91□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 A0A0J9YXY3 114 aa7.91□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 K7EP34 96 aa7.91□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.91□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.91□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 F5H768 121 aa7.9□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 DEFB130BP0DP73 79 aa7.9□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 DEFB130AP0DP74 79 aa7.9□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 HERVK_113P63121 156 aa7.9□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.9□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.9□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.9□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 RNF183Q96D59 192 aa7.9□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PGA3-201ENST00000325558 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 A8MZ25 164 aa7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 DEFB135Q30KP9 77 aa7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 TMEM101Q96IK0 257 aa7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 PRO0255Q9UI72 69 aa7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 MIFP14174 115 aa7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.89□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 GAGE10A6NGK3 116 aa7.88□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 SPINK8P0C7L1 97 aa7.88□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 CFC1BP0CG36 223 aa7.88□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 CFC1P0CG37 223 aa7.88□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP10-11P60412 298 aa7.88□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.87□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 A6NJY4 79 aa7.87□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.87□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 TIMM17BO60830 172 aa7.87□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 NDUFA1O15239 70 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 FABP2P12104 132 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 GYPEP15421 78 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 SPANXCQ9NY87 97 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 A0A1B0GUV1 79 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.86□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 GAGE6Q13070 117 aa7.85□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.85□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.85□□□□□ -1.15
PGA3-201ENST00000325558 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.85□□□□□ -1.15
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