RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A0J9YXY3 114 aa9.92□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 BPY2O14599 106 aa9.92□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.92□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF580Q9UK33 172 aa9.92□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 HIGD1BQ9P298 99 aa9.92□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.91□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 MED13Q9UHV7 2174 aa9.91□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 KLLNB2CW77 178 aa9.91□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.91□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.91□□□□□ -0.82
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PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM223A0PJW6 202 aa9.91□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.9□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.9□□□□□ -0.82
PDGFRB-201ENST00000261799 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.9□□□□□ -0.82
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PDGFRB-201ENST00000261799 LRP4O75096 1905 aa9.89□□□□□ -0.83
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PDGFRB-201ENST00000261799 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.89□□□□□ -0.83
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PDGFRB-201ENST00000261799 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.88□□□□□ -0.83
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PDGFRB-201ENST00000261799 A0A1W2PPR1 153 aa9.87□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6ZPA2 131 aa9.87□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.87□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.87□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.87□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLV2-8P01709 118 aa9.86□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 C10orf25Q5T742 122 aa9.86□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 CRIP3Q6Q6R5 217 aa9.86□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 USP17L23D6RBM5 183 aa9.86□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 TSHBP01222 138 aa9.86□□□□□ -0.83
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PDGFRB-201ENST00000261799 TTC28Q96AY4 2481 aa9.85□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 F8WDY8 70 aa9.85□□□□□ -0.83
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PDGFRB-201ENST00000261799 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 C1orf137Q5JT78 98 aa9.85□□□□□ -0.83
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLV2-11P01706 119 aa9.85□□□□□ -0.83
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PDGFRB-201ENST00000261799 H3BT86 120 aa9.85□□□□□ -0.83
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PDGFRB-201ENST00000261799 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.84□□□□□ -0.83
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PDGFRB-201ENST00000261799 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.83□□□□□ -0.84
PDGFRB-201ENST00000261799 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.82□□□□□ -0.84
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PDGFRB-201ENST00000261799 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.81□□□□□ -0.84
PDGFRB-201ENST00000261799 C6orf223Q8N319 242 aa9.81□□□□□ -0.84
PDGFRB-201ENST00000261799 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.8□□□□□ -0.84
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PDGFRB-201ENST00000261799 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.8□□□□□ -0.84
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PDGFRB-201ENST00000261799 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.8□□□□□ -0.84
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PDGFRB-201ENST00000261799 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.79□□□□□ -0.84
PDGFRB-201ENST00000261799 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.79□□□□□ -0.84
PDGFRB-201ENST00000261799 K7ERS5 55 aa9.78□□□□□ -0.84
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PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.78□□□□□ -0.84
PDGFRB-201ENST00000261799 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.78□□□□□ -0.84
PDGFRB-201ENST00000261799 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.77□□□□□ -0.84
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PDGFRB-201ENST00000261799 CCKP06307 115 aa9.77□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.77□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 NUPR1O60356 82 aa9.77□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 SLPIP03973 132 aa9.77□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 TEN1Q86WV5 123 aa9.76□□□□□ -0.85
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