RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Prss3Q792Z0 246 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Oxld1Q9CR10 201 aa22.25■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cnn1Q08091 297 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Smug1Q6P5C5 279 aa22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pygo1Q9D0P5 417 aa22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Hcfc1Q61191 2045 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cldn34c4A2ANA3 212 aa22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ascl2O35885 263 aa22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 TfpiO54819 306 aa22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 BsgP18572 389 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1434Q7TQR9 312 aa22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mixl1Q9WUI0 231 aa22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pf4Q9Z126 105 aa22.24■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 CenpeQ6RT24 2474 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ypel3P61237 119 aa22.23■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tmem256Q5F285 113 aa22.23■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gatad1Q920S3 266 aa22.23■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Wisp2Q9Z0G4 251 aa22.23■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rhox4gQ2MDF7 205 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rhox4dQ2MDG0 205 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rhox4eQ504P9 205 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Znf474Q6V5K9 347 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 OpalinQ7M750 143 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr263Q7TQT8 317 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm26566Q8CAC1 153 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Wipf1Q8K1I7 493 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr127Q8VF25 323 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr123Q8VFQ1 309 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mpv17lQ99MS3 194 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Necap2Q9D1J1 266 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 P03980 138 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Phxr2P15972 65 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rnf182Q8C432 247 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Dram1Q9DC58 238 aa22.22■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rnase9P60154 184 aa22.21■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 OstcQ78XF5 149 aa22.21■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ssbp3Q9D032 388 aa22.21■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm21900J3QP38 180 aa22.21■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Hoxa3P02831 443 aa22.21■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm9945Q8BNZ3 91 aa22.21■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rnase2aQ8K196 155 aa22.21■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cxcr6Q9EQ16 351 aa22.21■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 GlrxQ9QUH0 107 aa22.21■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Timm23Q9WTQ8 209 aa22.21■■□□□ 1.15
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ighv1-31A0A0A6YWK5 117 aa22.2■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1326-ps1A0A140T8J7 311 aa22.2■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Timp3P39876 211 aa22.2■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Arf6P62331 175 aa22.2■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Saxo2Q8BQB6 394 aa22.2■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm9949Q8C9F4 104 aa22.2■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Higd1cQ76I25 96 aa22.19■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 ChodlQ9CXM0 273 aa22.19■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zdhhc16Q9ESG8 361 aa22.19■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rab9aQ9R0M6 201 aa22.19■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zfhx3Q61329 3726 aa22.19■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Vmn1r60G3UY47 300 aa22.19■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 TgfaP48030 159 aa22.19■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm14851Q5ERJ0 116 aa22.19■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 C130073F10RikQ8C4L8 201 aa22.19■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 SpxD3Z752 116 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ighv4-1A0A075B5R5 116 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1116E9PXB8 307 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 P04944 107 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ccl1P10146 92 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Plp1P60202 277 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Spsb3Q571F5 354 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr147Q60886 317 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Oraov1Q8CH62 137 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mgst1Q91VS7 155 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Spg11Q3UHA3 2430 aa22.18■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ighv5-6A0A075B5Q0 117 aa22.17■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 LtaP09225 202 aa22.17■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Acaa1aQ921H8 424 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Parm1Q923D3 296 aa22.17■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sec16aA2AIX1 2377 aa22.17■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rhbdd1Q8BHC7 315 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Aqp6Q8C4A0 293 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 MmdQ9CQY7 238 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Vmn1r61W4VSP5 300 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 DysfQ9ESD7 2090 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zzef1Q5SSH7 2924 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zfp980A2A9J5 645 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 9130204L05RikG3UWB8 92 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lgals1P16045 135 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 9230109A22RikQ8BHE6 111 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ndufb3Q9CQZ6 104 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr959Q9EQ86 311 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rnase4Q9JJH1 148 aa22.16■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Abca7Q91V24 2159 aa22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ighv6-3A0A075B5T2 118 aa22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 S100a10P08207 97 aa22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rpl19P84099 196 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Oosp2Q4FZG8 168 aa22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tcf15Q60756 195 aa22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Slamf7Q8BHK6 333 aa22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr984Q8VFN1 314 aa22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Chac2Q9CQG1 178 aa22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1009Q8VFK1 314 aa22.15■■□□□ 1.14
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cldn16Q925N4 235 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.6 ms