RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMC4P43686 418 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 GPAT2Q6NUI2 795 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 RFX7Q2KHR2 1363 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF20L1A8MW92 1017 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 TNNQ9UQP3 1299 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 BCRP11274 1271 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 AK9Q5TCS8 1911 aa29.76■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB22O15209 634 aa29.76■■■□□ 2.35
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CAPNS1-216ENST00000628306 ATP2B3Q16720 1220 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 USP40Q9NVE5 1235 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 SIL1Q9H173 461 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO3Q9UK99 471 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCL11O14625 94 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
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CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2C8P10632 490 aa29.74■■■□□ 2.35
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CAPNS1-216ENST00000628306 DOCK2Q92608 1830 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 GAKO14976 1311 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 MYPNQ86TC9 1320 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 MGAMO43451 1857 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K10Q02779 954 aa29.73■■■□□ 2.35
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CAPNS1-216ENST00000628306 MYH2Q9UKX2 1941 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 ADORA1P30542 326 aa29.72■■■□□ 2.35
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CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRFP10586 1907 aa29.71■■■□□ 2.35
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CAPNS1-216ENST00000628306 RGS3P49796 1198 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.71■■■□□ 2.35
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CAPNS1-216ENST00000628306 CCL5P13501 91 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXD10P28358 340 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-216ENST00000628306 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
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CAPNS1-216ENST00000628306 RAET1EQ8TD07 263 aa29.7■■■□□ 2.35
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CAPNS1-216ENST00000628306 SCYL3Q8IZE3 742 aa29.69■■■□□ 2.34
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CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC102BQ68D86 513 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-216ENST00000628306 PRO3102Q9H379 93 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-216ENST00000628306 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
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CAPNS1-216ENST00000628306 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.65■■■□□ 2.34
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CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
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CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
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CAPNS1-216ENST00000628306 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 PICK1Q9NRD5 415 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 DOCK3Q8IZD9 2030 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 FLT3LGP49771 235 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 BTDP43251 543 aa29.59■■■□□ 2.33
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