RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626583.2

LINC01828-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1828, human

TSL 5

Gene LINC01828, Length 848 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01828-208	ENST00000626583	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LINC01828-208	ENST00000626583	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LINC01828-208	ENST00000626583	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	UPP2	O95045	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ITGB2	P05107	769 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	SHH	Q15465	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PTPN18	Q99952	460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	SPTLC1	O15269	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	RAD17	O75943	681 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	TCF15	Q12870	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	AOC3	Q16853	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	NME9	Q86XW9	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	SPEG	Q15772	3267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	TECTA	O75443	2155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	TONSL	Q96HA7	1378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	KCNH2	Q12809	1159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	BAP1	Q92560	729 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	MS4A1	P11836	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	BMP2	P12643	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	HOXC9	P31274	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	FKBP1B	P68106	108 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PTS	Q03393	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ITPKC	Q96DU7	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583		H7C1D1	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	NPR1	P16066	1061 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	GRK4	P32298	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	HLA-C	Q95604	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PSME4	Q14997	1843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	BPTF	Q12830	3046 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	GJA5	P36382	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PRKG1	Q13976	671 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC01828-208	ENST00000626583	PFAS	O15067	1338 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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