RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 SLIT2O94813 1529 aa9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 GCKRQ14397 625 aa9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 PROSER3Q2NL68 480 aa9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 BCORQ6W2J9 1755 aa9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 LRP5O75197 1615 aa9.93□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 CHRNA4P43681 627 aa9.92□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.92□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.92□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.92□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.92□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 IGKV5-2P06315 115 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 SLC39A6Q13433 755 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 COPS6Q7L5N1 327 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 COPRSQ9NQ92 184 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 ATG3Q9NT62 314 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 BTG4Q9NY30 223 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 PHF24Q9UPV7 400 aa9.91□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 ABCC12Q96J65 1359 aa9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 C2CD2LO14523 706 aa9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 TOM1O60784 492 aa9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 STARD3NLO95772 234 aa9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 AMPD1P23109 780 aa9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 USP26Q9BXU7 913 aa9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 STRN4Q9NRL3 753 aa9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTXN3-204ENST00000620385 SCN7AQ01118 1682 aa9.9□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 NHSQ6T4R5 1651 aa9.9□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 APBB1O00213 710 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 GNB5O14775 395 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 TRAK2O60296 914 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 ANXA1P04083 346 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 MYL6BP14649 208 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 PHKA2P46019 1235 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 PI4K2BQ8TCG2 481 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 SUCLG2Q96I99 432 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 MYD88Q99836 296 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 GPR108Q9NPR9 543 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa9.89□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 ZBBXA8MT70 800 aa9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 CHMLP26374 656 aa9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 NFKBIBQ15653 356 aa9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 EVI5LQ96CN4 794 aa9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 KIF2CQ99661 725 aa9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 GGA1Q9UJY5 639 aa9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 USP16Q9Y5T5 823 aa9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 NUP98P52948 1817 aa9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF609O15014 1411 aa9.88□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 CIAO1O76071 339 aa9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 FBXO45P0C2W1 286 aa9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 BMP4P12644 408 aa9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC125Q86Z20 511 aa9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 GBP4Q96PP9 640 aa9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 JCADQ9P266 1359 aa9.87□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 A0A087WZG4 1122 aa9.86□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 A0A1B0GTH6 734 aa9.86□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 EXOC5O00471 708 aa9.86□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 DDIT3P35638 169 aa9.86□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 DGKGP49619 791 aa9.86□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 CASP7P55210 303 aa9.86□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 DOC2BQ14184 412 aa9.86□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 BTBD6Q96KE9 485 aa9.86□□□□□ -0.83
CTXN3-204ENST00000620385 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.86□□□□□ -0.83
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