RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARHGAP6	O43182	974 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCP110	O43303	1012 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	CBFA2T2	O43439	604 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPP6R2	O75170	966 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	PRR29	P0C7W0	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	CASQ1	P31415	396 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	GNG11	P61952	73 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZSCAN26	Q16670	478 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	TICAM2	Q86XR7	235 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	DHX58	Q96C10	678 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	ALG1	Q9BT22	464 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATG3	Q9NT62	314 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZMYM6	O95789	1325 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYH8	P13535	1937 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	CPLX1	O14810	134 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF18	P17022	549 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZAP70	P43403	619 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF827	Q17R98	1081 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM66	O15016	1216 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	NRDC	O43847	1150 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	NTRK3	Q16288	839 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	NCOA7	Q8NI08	942 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	INCENP	Q9NQS7	918 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	GPAA1	O43292	621 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	CIAO1	O76071	339 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZBTB9	Q96C00	473 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		10.08	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	TPM1	P09493	284 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	PDILT	Q8N807	584 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYL10	Q9BUA6	226 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	CUTA	O60888	179 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	ICE2	Q659A1	982 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	APOA5	Q6Q788	366 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	IQUB	Q8NA54	791 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	APPBP2	Q92624	585 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	LRP6	O75581	1613 aa		10.07	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF213	O14771	459 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	STX10	O60499	249 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	A1BG	P04217	495 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	GUCY1A2	P33402	732 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8	2e-22	■■■■■ 36.2
UBE2V1-223	ENST00000617119	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	OLFM4	Q6UX06	510 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	SRL	Q86TD4	932 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	RABGGTA	Q92696	567 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	DCAF5	Q96JK2	942 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	AK7	Q96M32	723 aa		10.06	□□□□□ -0.8
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8

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