RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	LIG1	P18858	919 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	PRDX5	P30044	214 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TERF1	P54274	439 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	DYNC1I1	O14576	645 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	CUL4A	Q13619	759 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM5	Q9C035	493 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	CDC25A	P30304	524 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	DDIT3	P35638	169 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	PROM2	Q8N271	834 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TNMD	Q9H2S6	317 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP2D6	P10635	497 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT85	P78386	507 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM29	Q14134	588 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SCRN1	Q12765	414 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	F13A1	P00488	732 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	GRAP	Q13588	217 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L21	D6R901	530 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	UFL1	O94874	794 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNB2	Q92953	911 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	CLSTN1	O94985	981 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	PRKG1	Q13976	671 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF827	Q17R98	1081 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPY26P	Q9H489	355 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	MYH3	P11055	1940 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	RGL2	O15211	777 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	MARCH6	O60337	910 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	MMP10	P09238	476 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	11.39	□□□□□ -0.59	3e-6	■□□□□ 9.1
CTCFL-222	ENST00000609232	CBX1	P83916	185 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	DDR1	Q08345	913 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	MCM5	P33992	734 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC6	Q86TZ1	520 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	AFM	P43652	599 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.38	□□□□□ -0.59
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.38	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms