RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598934.5

LINC00854-210, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 337 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-210	ENST00000598934	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PTS	Q03393	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SCARF1	Q14162	830 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SULF2	Q8IWU5	870 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MARK1	Q9P0L2	795 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	KCNQ2	O43526	872 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	NINJ1	Q92982	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934		A0A087X0B3	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	BNIP3L	O60238	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	MAN1A2	O60476	641 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	B3GALT4	O96024	378 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GHRH	P01286	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CD33	P20138	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CDK8	P49336	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	TBX4	P57082	545 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GPLD1	P80108	840 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	DBN1	Q16643	649 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	UBR7	Q8N806	425 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LINC00854-210	ENST00000598934	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GPR25	O00155	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PRC1	O43663	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ADCY3	O60266	1144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	STAT3	P40763	770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	NFKB2	Q00653	900 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PMM1	Q92871	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SUSD5	O60279	629 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PDE8A	O60658	829 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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