RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591762.1

SPHK1-209, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPHK1, Length 2,502 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-209ENST00000591762 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.55■□□□□ 0.88
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SPHK1-209ENST00000591762 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPHK1-209ENST00000591762 CYP7A1P22680 504 aa20.54■□□□□ 0.88
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SPHK1-209ENST00000591762 PTPN14Q15678 1187 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-209ENST00000591762 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPHK1-209ENST00000591762 DOCK2Q92608 1830 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPHK1-209ENST00000591762 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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SPHK1-209ENST00000591762 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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SPHK1-209ENST00000591762 C8orf76Q96K31 380 aa20.48■□□□□ 0.87
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SPHK1-209ENST00000591762 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.47■□□□□ 0.87
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SPHK1-209ENST00000591762 CCZ1BP86790 482 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-209ENST00000591762 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-209ENST00000591762 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-209ENST00000591762 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-209ENST00000591762 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-209ENST00000591762 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-209ENST00000591762 NEMFO60524 1076 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-209ENST00000591762 CDC27P30260 824 aa20.47■□□□□ 0.87
SPHK1-209ENST00000591762 SYCP1Q15431 976 aa20.47■□□□□ 0.87
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