RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.98■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.98■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 TM4SF4P48230 202 aa22.97■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 RHBDL3P58872 404 aa22.97■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 AAMPQ13685 434 aa22.97■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 VGLL4Q14135 290 aa22.97■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 OPTNQ96CV9 577 aa22.97■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.97■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 AK9Q5TCS8 1911 aa22.96■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 GOLIM4O00461 696 aa22.96■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GIPC1-210ENST00000589497 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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GIPC1-210ENST00000589497 PPP4CP60510 307 aa22.95■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.95■■□□□ 1.26
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GIPC1-210ENST00000589497 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.94■■□□□ 1.26
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GIPC1-210ENST00000589497 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.94■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 ALDH1A1P00352 501 aa22.93■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.93■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 ERO1BQ86YB8 467 aa22.93■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.93■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.93■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.93■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.93■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
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GIPC1-210ENST00000589497 USP5P45974 858 aa22.91■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 GTF2A2P52657 109 aa22.91■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.91■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.91■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 HAUS7Q99871 368 aa22.91■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.91■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.91■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.9■■□□□ 1.26
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GIPC1-210ENST00000589497 IFNL1Q8IU54 200 aa22.9■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.9■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 GCC1Q96CN9 775 aa22.9■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GIPC1-210ENST00000589497 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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GIPC1-210ENST00000589497 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.9■■□□□ 1.26
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GIPC1-210ENST00000589497 PPATQ06203 517 aa22.89■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.89■■□□□ 1.25
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GIPC1-210ENST00000589497 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.88■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.88■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.88■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.87■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.87■■□□□ 1.25
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GIPC1-210ENST00000589497 CCL15Q16663 113 aa22.87■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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GIPC1-210ENST00000589497 FLT1P17948 1338 aa22.86■■□□□ 1.25
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GIPC1-210ENST00000589497 CETPP11597 493 aa22.86■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 PPIL2Q13356 520 aa22.86■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.86■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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GIPC1-210ENST00000589497 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.85■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 IRF6O14896 467 aa22.85■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 MAP3K10Q02779 954 aa22.85■■□□□ 1.25
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GIPC1-210ENST00000589497 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 PALD1Q9ULE6 856 aa22.85■■□□□ 1.25
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GIPC1-210ENST00000589497 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.83■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 FAM196BA6NMK8 535 aa22.83■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.83■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.83■■□□□ 1.25
GIPC1-210ENST00000589497 OTOFQ9HC10 1997 aa22.83■■□□□ 1.24
GIPC1-210ENST00000589497 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
GIPC1-210ENST00000589497 SLURP2P0DP57 97 aa22.82■■□□□ 1.24
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