RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SMC3Q9UQE7 1217 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE4AQ14139 1066 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM87AQ8NBN3 555 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 ADCK5Q3MIX3 580 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa30.11■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC10A3P09131 477 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS6KB1P23443 525 aa30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 PAG1Q9NWQ8 432 aa30.1■■■□□ 2.41
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CAPNS1-204ENST00000587718 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 MTMR14Q8NCE2 650 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 DSCC1Q9BVC3 393 aa30.09■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
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CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GUL7 405 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 MOB2Q70IA6 237 aa30.07■■■□□ 2.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa30.07■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM205AQ6ZU69 1335 aa30.07■■■□□ 2.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 STX6O43752 255 aa30.06■■■□□ 2.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa30.06■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 RASAL3Q86YV0 1011 aa30.06■■■□□ 2.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC158Q5M9N0 1113 aa30.05■■■□□ 2.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.05■■■□□ 2.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2Q2LH0YL09 131 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM43AQ8N2R8 423 aa30.03■■■□□ 2.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 CSRNP1Q96S65 589 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 F8W031 263 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 SYT1P21579 422 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO33Q7Z6M2 555 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 GPT2Q8TD30 523 aa30.03■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMM10P62072 90 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-204ENST00000587718 GAS2L3Q86XJ1 694 aa30.02■■■□□ 2.4
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CAPNS1-204ENST00000587718 PDE8BO95263 885 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-204ENST00000587718 SPDYE6P0CI01 402 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-204ENST00000587718 ME3Q16798 604 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP100Q494V2 611 aa30.01■■■□□ 2.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 F13A1P00488 732 aa30■■■□□ 2.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 CPA1P15085 419 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-204ENST00000587718 NF2P35240 595 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL24Q5JXM2 366 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC83Q8IWF9 413 aa29.99■■■□□ 2.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 RNF186Q9NXI6 227 aa29.99■■■□□ 2.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 LARGE1O95461 756 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-204ENST00000587718 GJB2P29033 226 aa29.98■■■□□ 2.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 TTC39AQ5SRH9 613 aa29.97■■■□□ 2.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 FGFR2P21802 821 aa29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-204ENST00000587718 ST3GAL1Q11201 340 aa29.95■■■□□ 2.39
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CAPNS1-204ENST00000587718 CLRN2A0PK11 232 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPA1O75762 1119 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-204ENST00000587718 GORABQ5T7V8 394 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXL16Q8N461 479 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINA10Q9UK55 444 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO1BO43795 1136 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP21A2P08686 494 aa29.94■■■□□ 2.38
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