RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CAVIN4Q5BKX8 364 aa19.16■□□□□ 0.66
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEC23AQ15436 765 aa19.09■□□□□ 0.65
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TIGD1Q96MW7 591 aa19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKRD2Q9GZV1 360 aa19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MINDY4BA8MYZ0 360 aa19.09■□□□□ 0.65
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