RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574453.5

MINK1-209, Transcript of misshapen like kinase 1, human

TSL 1 (best)

Gene MINK1, Length 4,941 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MINK1-209	ENST00000574453	MNAT1	P51948	309 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	POSTN	Q15063	836 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	NYX	Q9GZU5	481 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	MTX1	Q13505	466 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	IFT81	Q8WYA0	676 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	SCLT1	Q96NL6	688 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	ZNF853	P0CG23	659 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	LTK	P29376	864 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	STAM	Q92783	540 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PLA2R1	Q13018	1463 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	CHMP4BP1	P59074	171 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	TTC38	Q5R3I4	469 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	LPIN2	Q92539	896 aa		18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	VAV2	P52735	878 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PDE4D	Q08499	809 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PNOC	Q13519	176 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	KRT13	P13646	458 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	INCENP	Q9NQS7	918 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PFKFB1	P16118	471 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PLCD1	P51178	756 aa		18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PFKFB2	O60825	505 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PLCG2	P16885	1265 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	NBPF11	Q86T75	865 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	MAP4K1	Q92918	833 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	ZEB2	O60315	1214 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	KRT9	P35527	623 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	WDR78	Q5VTH9	848 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	BTG4	Q9NY30	223 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	TRAF5	O00463	557 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	CUL4A	Q13619	759 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PROSER3	Q2NL68	480 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	SV2B	Q7L1I2	683 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PLVAP	Q9BX97	442 aa		18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PAK1	Q13153	545 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	EBAG9	O00559	213 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	SPATA5	Q8NB90	893 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	BICD1	Q96G01	975 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	HAUS7	Q99871	368 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	TRIM14	Q14142	442 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	LONRF3	Q496Y0	759 aa		18.16	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	PARP10	Q53GL7	1025 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	NEBL	O76041	1014 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	ABCA8	O94911	1581 aa		18.14	■□□□□ 0.5
MINK1-209	ENST00000574453	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	MET	P08581	1390 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	TRAF1	Q13077	416 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	HSPA2	P54652	639 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	LRRC24	Q50LG9	513 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	TEX11	Q8IYF3	940 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	RGS22	Q8NE09	1264 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	18.13	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	FAM13A	O94988	1023 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	SCRN1	Q12765	414 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	TCIRG1	Q13488	830 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MINK1-209	ENST00000574453	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		18.13	■□□□□ 0.49

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