RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	SLURP2	P0DP57	97 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	USP5	P45974	858 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	PRKG1	Q13976	671 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	AIDA	Q96BJ3	306 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	GPAA1	O43292	621 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	PLCG2	P16885	1265 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	TNNI2	P48788	182 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	PPP4C	P60510	307 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	FSTL1	Q12841	308 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	FLT1	P17948	1338 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	EVX2	Q03828	476 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	TNFAIP1	Q13829	316 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	MOB2	Q70IA6	237 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	IDI2	Q9BXS1	227 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	PASK	Q96RG2	1323 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	LAMA4	Q16363	1823 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	IGSF3	O75054	1194 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	ENTPD3	O75355	529 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	CYP2D6	P10635	497 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	CHML	P26374	656 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	HTRA3	P83110	453 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	VPS53	Q5VIR6	699 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	TEPSIN	Q96N21	525 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	IL25	Q9H293	177 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	PALD1	Q9ULE6	856 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RPL4-208	ENST00000564744	SMIM22	K7EJ46	135 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	APP	P05067	770 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	C1QTNF8	P60827	252 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	DOCK1	Q14185	1865 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	CST9	Q5W186	159 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	FAM83A	Q86UY5	434 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	CSRNP1	Q96S65	589 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	HIP1	O00291	1037 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	NF2	P35240	595 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	FOXP2	O15409	715 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	CDC45	O75419	566 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	TDO2	P48775	406 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	CERS3	Q8IU89	383 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	USP17L12	C9JPN9	530 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	USP17L21	D6R901	530 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	PLCD1	P51178	756 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	APLP1	P51693	650 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	GRM1	Q13255	1194 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RPL4-208	ENST00000564744	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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