RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	KCNJ6	P48051	423 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	IFNK	Q9P0W0	207 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	NCAPH	Q15003	741 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	TMTC2	Q8N394	836 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	SENP2	Q9HC62	589 aa		21.25	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	CHD4	Q14839	1912 aa		21.24	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	RCAN1	P53805	252 aa		21.24	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		21.24	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	SHC4	Q6S5L8	630 aa		21.24	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		21.24	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		21.24	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	21.24	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		21.24	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	CBFA2T2	O43439	604 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	PARP10	Q53GL7	1025 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	STRC	Q7RTU9	1775 aa		21.23	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	ERICH2	A1L162	156 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	TUBB4A	P04350	444 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	TMC6	Q7Z403	805 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF592	Q92610	1267 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	ARMT1	Q9H993	441 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	RTL9	Q8NET4	1388 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	USP27X	A6NNY8	438 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	TDO2	P48775	406 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	MYL5	Q02045	173 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	OLFM4	Q6UX06	510 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	KIF18A	Q8NI77	898 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	ARID3A	Q99856	593 aa		21.22	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	21.21	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	FANCC	Q00597	558 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	SUSD4	Q5VX71	490 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	21.21	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	ZMYND15	Q9H091	742 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		21.21	■□□□□ 0.99
RRN3-205	ENST00000563559	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	MMP1	P03956	469 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	WTAP	Q15007	396 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	RTN1	Q16799	776 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	MYL10	Q9BUA6	226 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	CNNM3	Q8NE01	707 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		21.2	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	CCP110	O43303	1012 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	PPP2R5B	Q15173	497 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	FEZ1	Q99689	392 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	INCENP	Q9NQS7	918 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	21.19	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	DEXI	O95424	95 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	21.19	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		21.19	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	21.19	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	21.19	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	PNOC	Q13519	176 aa		21.18	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	TOMM22	Q9NS69	142 aa		21.18	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		21.18	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	LCORL	Q8N3X6	602 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	CLIC6	Q96NY7	704 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	SLIT2	O94813	1529 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	UBASH3A	P57075	661 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	LONRF3	Q496Y0	759 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		21.17	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINC1	P01008	464 aa		21.16	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	BCAM	P50895	628 aa		21.16	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	21.16	■□□□□ 0.98

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