RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
USP10-208ENST00000563386 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
USP10-208ENST00000563386 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.02■■□□□ 1.28
USP10-208ENST00000563386 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
USP10-208ENST00000563386 MAP3K12Q12852 859 aa23.01■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.01■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 OPTNQ96CV9 577 aa23.01■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.01■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 SREBF2Q12772 1141 aa23■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 RFX7Q2KHR2 1363 aa23■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 PLCG2P16885 1265 aa22.99■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 GJA5P36382 358 aa22.99■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.99■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 OTUD5Q96G74 571 aa22.99■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 ATP5JP18859 108 aa22.98■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 INPP5BP32019 993 aa22.98■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 TM4SF4P48230 202 aa22.98■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 TNS4Q8IZW8 715 aa22.98■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 SLURP2P0DP57 97 aa22.97■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 PPP4CP60510 307 aa22.97■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.97■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.97■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.97■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.97■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.97■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.97■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 DOCK2Q92608 1830 aa22.96■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 IGSF3O75054 1194 aa22.96■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.96■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
USP10-208ENST00000563386 TBC1D8O95759 1140 aa22.95■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 ERO1BQ86YB8 467 aa22.95■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 GPATCH3Q96I76 525 aa22.95■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 HAUS7Q99871 368 aa22.95■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.95■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 PDE6AP16499 860 aa22.94■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 INHBEP58166 350 aa22.94■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.94■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.94■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.93■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.93■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 FAM196BA6NMK8 535 aa22.93■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 29.3
USP10-208ENST00000563386 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.92■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 USP5P45974 858 aa22.92■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.92■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.92■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 IFNL1Q8IU54 200 aa22.92■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 FLT1P17948 1338 aa22.91■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.91■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.91■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 GTF2A2P52657 109 aa22.91■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 AAMPQ13685 434 aa22.91■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 CCL15Q16663 113 aa22.91■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 PALD1Q9ULE6 856 aa22.91■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.9■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.9■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 PPIL2Q13356 520 aa22.9■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 CERS3Q8IU89 383 aa22.9■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.9■■□□□ 1.26
USP10-208ENST00000563386 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
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USP10-208ENST00000563386 IRF6O14896 467 aa22.89■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 ALDH1A1P00352 501 aa22.89■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.89■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.89■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.89■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 PTPN18Q99952 460 aa22.89■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.89■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.89■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 MAP3K10Q02779 954 aa22.88■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 PPATQ06203 517 aa22.88■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 SNAPC2Q13487 334 aa22.88■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.88■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 GCC1Q96CN9 775 aa22.88■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.88■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.88■■□□□ 1.25
USP10-208ENST00000563386 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.87■■□□□ 1.25
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