RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE3CQ15386 1083 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 ECE1P42892 770 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 PRKG1Q13976 671 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.81■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K11Q16584 847 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 DCAF15Q66K64 600 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 MOB2Q70IA6 237 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 FSD1Q9BTV5 496 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.8■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 RGMBQ6NW40 437 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 CSRNP1Q96S65 589 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 FLT1P17948 1338 aa22.79■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 EVI5LQ96CN4 794 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 CAPNS2Q96L46 248 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 FZD1Q9UP38 647 aa22.78■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 UNCXA6NJT0 531 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 VEGFBP49765 207 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 MBD4O95243 580 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 USP5P45974 858 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 GRM1Q13255 1194 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 APPBP2Q92624 585 aa22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 PDE4AP27815 886 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 LCORLQ8N3X6 602 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC102AQ96A19 550 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 AIDAQ96BJ3 306 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 CHGBP05060 677 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 ARMT1Q9H993 441 aa22.74■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPRFP10586 1907 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC10A3P09131 477 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 NOGQ13253 232 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 TICAM2Q86XR7 235 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 WRNIP1Q96S55 665 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 CSADQ9Y600 493 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.73■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 JMYQ8N9B5 988 aa22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
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RABGGTA-208ENST00000558954 RILPL2Q969X0 211 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-208ENST00000558954 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.71■■□□□ 1.23
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RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K9P80192 1104 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 VGLL4Q14135 290 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 OSBP2Q969R2 916 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 PALD1Q9ULE6 856 aa22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D12O60347 775 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K10Q02779 954 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 TTC22Q5TAA0 569 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 PCNTO95613 3336 aa22.67■■□□□ 1.22
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